Protein–RNA interactions for Protein: Q969F2

NKD2, Protein naked cuticle homolog 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKD2Q969F2 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NKD2Q969F2 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NKD2Q969F2 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NKD2Q969F2 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NKD2Q969F2 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NKD2Q969F2 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
NKD2Q969F2 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NKD2Q969F2 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NKD2Q969F2 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NKD2Q969F2 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NKD2Q969F2 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NKD2Q969F2 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NKD2Q969F2 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NKD2Q969F2 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NKD2Q969F2 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NKD2Q969F2 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NKD2Q969F2 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NKD2Q969F2 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NKD2Q969F2 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NKD2Q969F2 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NKD2Q969F2 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NKD2Q969F2 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NKD2Q969F2 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NKD2Q969F2 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NKD2Q969F2 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NKD2Q969F2 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NKD2Q969F2 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NKD2Q969F2 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NKD2Q969F2 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NKD2Q969F2 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NKD2Q969F2 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NKD2Q969F2 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NKD2Q969F2 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NKD2Q969F2 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NKD2Q969F2 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
NKD2Q969F2 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NKD2Q969F2 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NKD2Q969F2 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
NKD2Q969F2 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NKD2Q969F2 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NKD2Q969F2 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NKD2Q969F2 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
NKD2Q969F2 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NKD2Q969F2 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NKD2Q969F2 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NKD2Q969F2 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NKD2Q969F2 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NKD2Q969F2 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
NKD2Q969F2 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC21.32■■□□□ 1
NKD2Q969F2 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC21.32■■□□□ 1
NKD2Q969F2 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NKD2Q969F2 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NKD2Q969F2 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NKD2Q969F2 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NKD2Q969F2 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NKD2Q969F2 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NKD2Q969F2 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NKD2Q969F2 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NKD2Q969F2 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NKD2Q969F2 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NKD2Q969F2 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NKD2Q969F2 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NKD2Q969F2 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NKD2Q969F2 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
NKD2Q969F2 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NKD2Q969F2 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
NKD2Q969F2 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC21.31■■□□□ 1
NKD2Q969F2 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
NKD2Q969F2 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
NKD2Q969F2 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NKD2Q969F2 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NKD2Q969F2 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NKD2Q969F2 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NKD2Q969F2 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NKD2Q969F2 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NKD2Q969F2 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NKD2Q969F2 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NKD2Q969F2 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NKD2Q969F2 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NKD2Q969F2 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
NKD2Q969F2 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NKD2Q969F2 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NKD2Q969F2 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
NKD2Q969F2 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
NKD2Q969F2 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
NKD2Q969F2 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
NKD2Q969F2 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC21.3■■□□□ 1
NKD2Q969F2 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
NKD2Q969F2 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC21.29■■□□□ 1
NKD2Q969F2 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NKD2Q969F2 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NKD2Q969F2 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NKD2Q969F2 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NKD2Q969F2 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
NKD2Q969F2 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NKD2Q969F2 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NKD2Q969F2 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NKD2Q969F2 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NKD2Q969F2 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NKD2Q969F2 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms