Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6G5

CSGALNACT2, Chondroitin sulfate N-acetylgalactosaminyltransferase 2, humanhuman

Predictions only

Length 542 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSGALNACT2Q8N6G5 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CSGALNACT2Q8N6G5 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CSGALNACT2Q8N6G5 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CSGALNACT2Q8N6G5 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CSGALNACT2Q8N6G5 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CSGALNACT2Q8N6G5 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CSGALNACT2Q8N6G5 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CSGALNACT2Q8N6G5 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CSGALNACT2Q8N6G5 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CSGALNACT2Q8N6G5 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CSGALNACT2Q8N6G5 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CSGALNACT2Q8N6G5 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CSGALNACT2Q8N6G5 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CSGALNACT2Q8N6G5 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CSGALNACT2Q8N6G5 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CSGALNACT2Q8N6G5 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CSGALNACT2Q8N6G5 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CSGALNACT2Q8N6G5 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CSGALNACT2Q8N6G5 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CSGALNACT2Q8N6G5 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CSGALNACT2Q8N6G5 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CSGALNACT2Q8N6G5 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CSGALNACT2Q8N6G5 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CSGALNACT2Q8N6G5 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CSGALNACT2Q8N6G5 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CSGALNACT2Q8N6G5 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CSGALNACT2Q8N6G5 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CSGALNACT2Q8N6G5 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CSGALNACT2Q8N6G5 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CSGALNACT2Q8N6G5 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CSGALNACT2Q8N6G5 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CSGALNACT2Q8N6G5 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CSGALNACT2Q8N6G5 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CSGALNACT2Q8N6G5 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CSGALNACT2Q8N6G5 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CSGALNACT2Q8N6G5 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CSGALNACT2Q8N6G5 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CSGALNACT2Q8N6G5 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CSGALNACT2Q8N6G5 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CSGALNACT2Q8N6G5 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CSGALNACT2Q8N6G5 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CSGALNACT2Q8N6G5 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CSGALNACT2Q8N6G5 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CSGALNACT2Q8N6G5 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CSGALNACT2Q8N6G5 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CSGALNACT2Q8N6G5 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CSGALNACT2Q8N6G5 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CSGALNACT2Q8N6G5 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CSGALNACT2Q8N6G5 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CSGALNACT2Q8N6G5 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CSGALNACT2Q8N6G5 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CSGALNACT2Q8N6G5 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CSGALNACT2Q8N6G5 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CSGALNACT2Q8N6G5 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CSGALNACT2Q8N6G5 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CSGALNACT2Q8N6G5 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CSGALNACT2Q8N6G5 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CSGALNACT2Q8N6G5 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CSGALNACT2Q8N6G5 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CSGALNACT2Q8N6G5 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CSGALNACT2Q8N6G5 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CSGALNACT2Q8N6G5 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CSGALNACT2Q8N6G5 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CSGALNACT2Q8N6G5 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CSGALNACT2Q8N6G5 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
CSGALNACT2Q8N6G5 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CSGALNACT2Q8N6G5 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CSGALNACT2Q8N6G5 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CSGALNACT2Q8N6G5 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CSGALNACT2Q8N6G5 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CSGALNACT2Q8N6G5 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CSGALNACT2Q8N6G5 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CSGALNACT2Q8N6G5 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CSGALNACT2Q8N6G5 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CSGALNACT2Q8N6G5 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CSGALNACT2Q8N6G5 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CSGALNACT2Q8N6G5 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CSGALNACT2Q8N6G5 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CSGALNACT2Q8N6G5 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CSGALNACT2Q8N6G5 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CSGALNACT2Q8N6G5 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CSGALNACT2Q8N6G5 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CSGALNACT2Q8N6G5 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CSGALNACT2Q8N6G5 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CSGALNACT2Q8N6G5 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CSGALNACT2Q8N6G5 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CSGALNACT2Q8N6G5 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CSGALNACT2Q8N6G5 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CSGALNACT2Q8N6G5 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CSGALNACT2Q8N6G5 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CSGALNACT2Q8N6G5 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CSGALNACT2Q8N6G5 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CSGALNACT2Q8N6G5 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CSGALNACT2Q8N6G5 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CSGALNACT2Q8N6G5 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CSGALNACT2Q8N6G5 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CSGALNACT2Q8N6G5 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CSGALNACT2Q8N6G5 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CSGALNACT2Q8N6G5 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CSGALNACT2Q8N6G5 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms