Protein–RNA interactions for Protein: Q86UT8

CCDC84, Coiled-coil domain-containing protein 84, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC84Q86UT8 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC84Q86UT8 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC84Q86UT8 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC84Q86UT8 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC84Q86UT8 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC84Q86UT8 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC84Q86UT8 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC84Q86UT8 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC84Q86UT8 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC84Q86UT8 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC84Q86UT8 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC84Q86UT8 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC84Q86UT8 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC84Q86UT8 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC84Q86UT8 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC84Q86UT8 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC84Q86UT8 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC84Q86UT8 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC84Q86UT8 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC84Q86UT8 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC84Q86UT8 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC84Q86UT8 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC84Q86UT8 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC84Q86UT8 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC84Q86UT8 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC84Q86UT8 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC84Q86UT8 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC84Q86UT8 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC84Q86UT8 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC84Q86UT8 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC84Q86UT8 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC84Q86UT8 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC84Q86UT8 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC84Q86UT8 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC84Q86UT8 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC84Q86UT8 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC84Q86UT8 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC84Q86UT8 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC84Q86UT8 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC84Q86UT8 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC84Q86UT8 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC84Q86UT8 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC84Q86UT8 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC84Q86UT8 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC84Q86UT8 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC84Q86UT8 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC84Q86UT8 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC84Q86UT8 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC84Q86UT8 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC84Q86UT8 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC84Q86UT8 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC84Q86UT8 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC84Q86UT8 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC84Q86UT8 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC84Q86UT8 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC84Q86UT8 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC84Q86UT8 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC84Q86UT8 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC84Q86UT8 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC84Q86UT8 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC84Q86UT8 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.39
CCDC84Q86UT8 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC84Q86UT8 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC84Q86UT8 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC84Q86UT8 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC84Q86UT8 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC84Q86UT8 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC84Q86UT8 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC84Q86UT8 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC84Q86UT8 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC84Q86UT8 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC84Q86UT8 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC84Q86UT8 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC84Q86UT8 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC84Q86UT8 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC84Q86UT8 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC84Q86UT8 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC84Q86UT8 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC84Q86UT8 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC84Q86UT8 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC84Q86UT8 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC84Q86UT8 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC84Q86UT8 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC84Q86UT8 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC84Q86UT8 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC84Q86UT8 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC84Q86UT8 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC84Q86UT8 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC84Q86UT8 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC84Q86UT8 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC84Q86UT8 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC84Q86UT8 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC84Q86UT8 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC84Q86UT8 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC84Q86UT8 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC84Q86UT8 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC84Q86UT8 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC84Q86UT8 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC84Q86UT8 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC84Q86UT8 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms