Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZW31

SYDE1, Rho GTPase-activating protein SYDE1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 735 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYDE1Q6ZW31 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SYDE1Q6ZW31 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SYDE1Q6ZW31 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SYDE1Q6ZW31 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SYDE1Q6ZW31 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SYDE1Q6ZW31 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SYDE1Q6ZW31 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SYDE1Q6ZW31 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SYDE1Q6ZW31 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SYDE1Q6ZW31 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SYDE1Q6ZW31 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SYDE1Q6ZW31 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SYDE1Q6ZW31 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SYDE1Q6ZW31 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SYDE1Q6ZW31 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SYDE1Q6ZW31 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SYDE1Q6ZW31 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SYDE1Q6ZW31 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SYDE1Q6ZW31 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SYDE1Q6ZW31 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SYDE1Q6ZW31 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SYDE1Q6ZW31 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SYDE1Q6ZW31 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SYDE1Q6ZW31 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SYDE1Q6ZW31 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SYDE1Q6ZW31 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SYDE1Q6ZW31 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SYDE1Q6ZW31 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SYDE1Q6ZW31 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SYDE1Q6ZW31 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SYDE1Q6ZW31 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SYDE1Q6ZW31 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SYDE1Q6ZW31 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SYDE1Q6ZW31 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SYDE1Q6ZW31 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SYDE1Q6ZW31 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SYDE1Q6ZW31 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SYDE1Q6ZW31 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
SYDE1Q6ZW31 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
SYDE1Q6ZW31 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SYDE1Q6ZW31 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SYDE1Q6ZW31 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SYDE1Q6ZW31 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SYDE1Q6ZW31 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SYDE1Q6ZW31 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
SYDE1Q6ZW31 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SYDE1Q6ZW31 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SYDE1Q6ZW31 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SYDE1Q6ZW31 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SYDE1Q6ZW31 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SYDE1Q6ZW31 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SYDE1Q6ZW31 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SYDE1Q6ZW31 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SYDE1Q6ZW31 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SYDE1Q6ZW31 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SYDE1Q6ZW31 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SYDE1Q6ZW31 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SYDE1Q6ZW31 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SYDE1Q6ZW31 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
SYDE1Q6ZW31 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SYDE1Q6ZW31 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SYDE1Q6ZW31 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SYDE1Q6ZW31 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SYDE1Q6ZW31 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SYDE1Q6ZW31 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SYDE1Q6ZW31 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SYDE1Q6ZW31 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SYDE1Q6ZW31 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SYDE1Q6ZW31 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
SYDE1Q6ZW31 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SYDE1Q6ZW31 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SYDE1Q6ZW31 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SYDE1Q6ZW31 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SYDE1Q6ZW31 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SYDE1Q6ZW31 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SYDE1Q6ZW31 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SYDE1Q6ZW31 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SYDE1Q6ZW31 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SYDE1Q6ZW31 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SYDE1Q6ZW31 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SYDE1Q6ZW31 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SYDE1Q6ZW31 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SYDE1Q6ZW31 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SYDE1Q6ZW31 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SYDE1Q6ZW31 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SYDE1Q6ZW31 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SYDE1Q6ZW31 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SYDE1Q6ZW31 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SYDE1Q6ZW31 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SYDE1Q6ZW31 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SYDE1Q6ZW31 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SYDE1Q6ZW31 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SYDE1Q6ZW31 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
SYDE1Q6ZW31 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SYDE1Q6ZW31 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SYDE1Q6ZW31 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SYDE1Q6ZW31 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SYDE1Q6ZW31 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
SYDE1Q6ZW31 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SYDE1Q6ZW31 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms