Protein–RNA interactions for Protein: Q6U841

SLC4A10, Sodium-driven chloride bicarbonate exchanger, humanhuman

Predictions only

Length 1,118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A10Q6U841 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SLC4A10Q6U841 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SLC4A10Q6U841 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SLC4A10Q6U841 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SLC4A10Q6U841 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SLC4A10Q6U841 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SLC4A10Q6U841 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC25.58■■□□□ 1.68
SLC4A10Q6U841 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
SLC4A10Q6U841 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
SLC4A10Q6U841 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
SLC4A10Q6U841 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
SLC4A10Q6U841 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLC4A10Q6U841 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLC4A10Q6U841 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLC4A10Q6U841 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
SLC4A10Q6U841 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLC4A10Q6U841 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLC4A10Q6U841 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLC4A10Q6U841 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLC4A10Q6U841 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLC4A10Q6U841 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLC4A10Q6U841 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLC4A10Q6U841 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SLC4A10Q6U841 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC4A10Q6U841 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC4A10Q6U841 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC4A10Q6U841 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC4A10Q6U841 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC4A10Q6U841 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC4A10Q6U841 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC4A10Q6U841 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC4A10Q6U841 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC4A10Q6U841 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC4A10Q6U841 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC4A10Q6U841 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC4A10Q6U841 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC4A10Q6U841 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC4A10Q6U841 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC4A10Q6U841 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC4A10Q6U841 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC4A10Q6U841 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC4A10Q6U841 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC4A10Q6U841 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC4A10Q6U841 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC4A10Q6U841 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC4A10Q6U841 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC4A10Q6U841 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SLC4A10Q6U841 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLC4A10Q6U841 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLC4A10Q6U841 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLC4A10Q6U841 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLC4A10Q6U841 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLC4A10Q6U841 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLC4A10Q6U841 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLC4A10Q6U841 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLC4A10Q6U841 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLC4A10Q6U841 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLC4A10Q6U841 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLC4A10Q6U841 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
SLC4A10Q6U841 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
SLC4A10Q6U841 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLC4A10Q6U841 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLC4A10Q6U841 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLC4A10Q6U841 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLC4A10Q6U841 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
SLC4A10Q6U841 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLC4A10Q6U841 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLC4A10Q6U841 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLC4A10Q6U841 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SLC4A10Q6U841 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC4A10Q6U841 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC4A10Q6U841 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC4A10Q6U841 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC4A10Q6U841 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC4A10Q6U841 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC4A10Q6U841 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC4A10Q6U841 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC4A10Q6U841 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC4A10Q6U841 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC4A10Q6U841 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC4A10Q6U841 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SLC4A10Q6U841 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC4A10Q6U841 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC4A10Q6U841 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC4A10Q6U841 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC4A10Q6U841 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC4A10Q6U841 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC4A10Q6U841 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC4A10Q6U841 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC4A10Q6U841 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC4A10Q6U841 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC4A10Q6U841 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC4A10Q6U841 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC4A10Q6U841 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC4A10Q6U841 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SLC4A10Q6U841 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC4A10Q6U841 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC4A10Q6U841 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC4A10Q6U841 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
SLC4A10Q6U841 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms