Protein–RNA interactions for Protein: Q6TFL3

CCDC171, Coiled-coil domain-containing protein 171, humanhuman

Predictions only

Length 1,326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC171Q6TFL3 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC171Q6TFL3 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC171Q6TFL3 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC171Q6TFL3 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC171Q6TFL3 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC171Q6TFL3 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC171Q6TFL3 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC171Q6TFL3 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC171Q6TFL3 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC171Q6TFL3 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC171Q6TFL3 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC171Q6TFL3 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC171Q6TFL3 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC171Q6TFL3 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC171Q6TFL3 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC171Q6TFL3 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC171Q6TFL3 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC171Q6TFL3 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC171Q6TFL3 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC171Q6TFL3 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC171Q6TFL3 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC171Q6TFL3 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC171Q6TFL3 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC171Q6TFL3 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC171Q6TFL3 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC171Q6TFL3 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC171Q6TFL3 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC171Q6TFL3 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC171Q6TFL3 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC171Q6TFL3 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC171Q6TFL3 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC171Q6TFL3 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC171Q6TFL3 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC171Q6TFL3 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC171Q6TFL3 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC171Q6TFL3 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC171Q6TFL3 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC171Q6TFL3 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC171Q6TFL3 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC171Q6TFL3 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC171Q6TFL3 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC171Q6TFL3 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC171Q6TFL3 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC171Q6TFL3 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC171Q6TFL3 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC171Q6TFL3 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC171Q6TFL3 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC171Q6TFL3 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC171Q6TFL3 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC171Q6TFL3 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC171Q6TFL3 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC171Q6TFL3 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC171Q6TFL3 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC171Q6TFL3 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC171Q6TFL3 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC171Q6TFL3 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC171Q6TFL3 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC171Q6TFL3 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC171Q6TFL3 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC171Q6TFL3 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC171Q6TFL3 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC171Q6TFL3 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC171Q6TFL3 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC171Q6TFL3 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC171Q6TFL3 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC171Q6TFL3 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC171Q6TFL3 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC171Q6TFL3 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC171Q6TFL3 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC171Q6TFL3 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC171Q6TFL3 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC171Q6TFL3 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC171Q6TFL3 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC171Q6TFL3 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC171Q6TFL3 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC171Q6TFL3 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC171Q6TFL3 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC171Q6TFL3 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC171Q6TFL3 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC171Q6TFL3 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC171Q6TFL3 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC171Q6TFL3 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC171Q6TFL3 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC171Q6TFL3 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC171Q6TFL3 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC171Q6TFL3 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC171Q6TFL3 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC171Q6TFL3 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC171Q6TFL3 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC171Q6TFL3 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC171Q6TFL3 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC171Q6TFL3 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC171Q6TFL3 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC171Q6TFL3 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC171Q6TFL3 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC171Q6TFL3 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC171Q6TFL3 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC171Q6TFL3 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC171Q6TFL3 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC171Q6TFL3 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms