Protein–RNA interactions for Protein: Q6S5L8

SHC4, SHC-transforming protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHC4Q6S5L8 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SHC4Q6S5L8 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SHC4Q6S5L8 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SHC4Q6S5L8 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SHC4Q6S5L8 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SHC4Q6S5L8 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SHC4Q6S5L8 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SHC4Q6S5L8 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SHC4Q6S5L8 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SHC4Q6S5L8 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SHC4Q6S5L8 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SHC4Q6S5L8 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SHC4Q6S5L8 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SHC4Q6S5L8 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SHC4Q6S5L8 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SHC4Q6S5L8 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SHC4Q6S5L8 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SHC4Q6S5L8 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SHC4Q6S5L8 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SHC4Q6S5L8 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SHC4Q6S5L8 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SHC4Q6S5L8 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SHC4Q6S5L8 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SHC4Q6S5L8 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SHC4Q6S5L8 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SHC4Q6S5L8 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SHC4Q6S5L8 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SHC4Q6S5L8 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SHC4Q6S5L8 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SHC4Q6S5L8 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SHC4Q6S5L8 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SHC4Q6S5L8 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SHC4Q6S5L8 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SHC4Q6S5L8 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SHC4Q6S5L8 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SHC4Q6S5L8 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SHC4Q6S5L8 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SHC4Q6S5L8 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SHC4Q6S5L8 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SHC4Q6S5L8 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SHC4Q6S5L8 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SHC4Q6S5L8 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SHC4Q6S5L8 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SHC4Q6S5L8 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SHC4Q6S5L8 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SHC4Q6S5L8 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SHC4Q6S5L8 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SHC4Q6S5L8 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SHC4Q6S5L8 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SHC4Q6S5L8 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SHC4Q6S5L8 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SHC4Q6S5L8 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SHC4Q6S5L8 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SHC4Q6S5L8 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SHC4Q6S5L8 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SHC4Q6S5L8 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SHC4Q6S5L8 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SHC4Q6S5L8 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SHC4Q6S5L8 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SHC4Q6S5L8 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SHC4Q6S5L8 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SHC4Q6S5L8 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SHC4Q6S5L8 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SHC4Q6S5L8 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SHC4Q6S5L8 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SHC4Q6S5L8 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SHC4Q6S5L8 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SHC4Q6S5L8 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SHC4Q6S5L8 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SHC4Q6S5L8 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SHC4Q6S5L8 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SHC4Q6S5L8 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SHC4Q6S5L8 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SHC4Q6S5L8 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SHC4Q6S5L8 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SHC4Q6S5L8 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SHC4Q6S5L8 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SHC4Q6S5L8 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SHC4Q6S5L8 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SHC4Q6S5L8 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SHC4Q6S5L8 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SHC4Q6S5L8 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SHC4Q6S5L8 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SHC4Q6S5L8 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SHC4Q6S5L8 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SHC4Q6S5L8 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SHC4Q6S5L8 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SHC4Q6S5L8 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SHC4Q6S5L8 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SHC4Q6S5L8 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SHC4Q6S5L8 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SHC4Q6S5L8 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SHC4Q6S5L8 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SHC4Q6S5L8 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SHC4Q6S5L8 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SHC4Q6S5L8 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SHC4Q6S5L8 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SHC4Q6S5L8 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SHC4Q6S5L8 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SHC4Q6S5L8 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms