Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2S7

TTC41P, Putative tetratricopeptide repeat protein 41, humanhuman

Predictions only

Length 1,318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC41PQ6P2S7 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
TTC41PQ6P2S7 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.52
TTC41PQ6P2S7 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
TTC41PQ6P2S7 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
TTC41PQ6P2S7 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
TTC41PQ6P2S7 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
TTC41PQ6P2S7 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TTC41PQ6P2S7 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TTC41PQ6P2S7 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TTC41PQ6P2S7 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TTC41PQ6P2S7 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TTC41PQ6P2S7 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TTC41PQ6P2S7 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TTC41PQ6P2S7 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TTC41PQ6P2S7 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TTC41PQ6P2S7 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
TTC41PQ6P2S7 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TTC41PQ6P2S7 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TTC41PQ6P2S7 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TTC41PQ6P2S7 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TTC41PQ6P2S7 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TTC41PQ6P2S7 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TTC41PQ6P2S7 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TTC41PQ6P2S7 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
TTC41PQ6P2S7 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TTC41PQ6P2S7 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TTC41PQ6P2S7 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TTC41PQ6P2S7 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
TTC41PQ6P2S7 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TTC41PQ6P2S7 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TTC41PQ6P2S7 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TTC41PQ6P2S7 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
TTC41PQ6P2S7 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TTC41PQ6P2S7 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TTC41PQ6P2S7 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TTC41PQ6P2S7 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TTC41PQ6P2S7 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TTC41PQ6P2S7 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
TTC41PQ6P2S7 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TTC41PQ6P2S7 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TTC41PQ6P2S7 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TTC41PQ6P2S7 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TTC41PQ6P2S7 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TTC41PQ6P2S7 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TTC41PQ6P2S7 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TTC41PQ6P2S7 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TTC41PQ6P2S7 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TTC41PQ6P2S7 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TTC41PQ6P2S7 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TTC41PQ6P2S7 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TTC41PQ6P2S7 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TTC41PQ6P2S7 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TTC41PQ6P2S7 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TTC41PQ6P2S7 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TTC41PQ6P2S7 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TTC41PQ6P2S7 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TTC41PQ6P2S7 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
TTC41PQ6P2S7 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TTC41PQ6P2S7 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TTC41PQ6P2S7 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TTC41PQ6P2S7 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TTC41PQ6P2S7 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TTC41PQ6P2S7 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TTC41PQ6P2S7 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TTC41PQ6P2S7 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TTC41PQ6P2S7 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
TTC41PQ6P2S7 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TTC41PQ6P2S7 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TTC41PQ6P2S7 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TTC41PQ6P2S7 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TTC41PQ6P2S7 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TTC41PQ6P2S7 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TTC41PQ6P2S7 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TTC41PQ6P2S7 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TTC41PQ6P2S7 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TTC41PQ6P2S7 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
TTC41PQ6P2S7 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TTC41PQ6P2S7 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TTC41PQ6P2S7 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TTC41PQ6P2S7 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TTC41PQ6P2S7 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TTC41PQ6P2S7 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TTC41PQ6P2S7 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TTC41PQ6P2S7 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TTC41PQ6P2S7 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TTC41PQ6P2S7 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TTC41PQ6P2S7 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TTC41PQ6P2S7 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TTC41PQ6P2S7 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TTC41PQ6P2S7 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TTC41PQ6P2S7 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TTC41PQ6P2S7 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TTC41PQ6P2S7 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TTC41PQ6P2S7 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TTC41PQ6P2S7 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TTC41PQ6P2S7 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TTC41PQ6P2S7 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TTC41PQ6P2S7 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TTC41PQ6P2S7 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TTC41PQ6P2S7 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms