Protein–RNA interactions for Protein: Q5BN46

C9orf116, UPF0691 protein C9orf116, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf116Q5BN46 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
C9orf116Q5BN46 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
C9orf116Q5BN46 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
C9orf116Q5BN46 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
C9orf116Q5BN46 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
C9orf116Q5BN46 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
C9orf116Q5BN46 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
C9orf116Q5BN46 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
C9orf116Q5BN46 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
C9orf116Q5BN46 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
C9orf116Q5BN46 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
C9orf116Q5BN46 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
C9orf116Q5BN46 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
C9orf116Q5BN46 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
C9orf116Q5BN46 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
C9orf116Q5BN46 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
C9orf116Q5BN46 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
C9orf116Q5BN46 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
C9orf116Q5BN46 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
C9orf116Q5BN46 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
C9orf116Q5BN46 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
C9orf116Q5BN46 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
C9orf116Q5BN46 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
C9orf116Q5BN46 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
C9orf116Q5BN46 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
C9orf116Q5BN46 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
C9orf116Q5BN46 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
C9orf116Q5BN46 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
C9orf116Q5BN46 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
C9orf116Q5BN46 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
C9orf116Q5BN46 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
C9orf116Q5BN46 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
C9orf116Q5BN46 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
C9orf116Q5BN46 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
C9orf116Q5BN46 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
C9orf116Q5BN46 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
C9orf116Q5BN46 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
C9orf116Q5BN46 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
C9orf116Q5BN46 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
C9orf116Q5BN46 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
C9orf116Q5BN46 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
C9orf116Q5BN46 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
C9orf116Q5BN46 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
C9orf116Q5BN46 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
C9orf116Q5BN46 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
C9orf116Q5BN46 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
C9orf116Q5BN46 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
C9orf116Q5BN46 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
C9orf116Q5BN46 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
C9orf116Q5BN46 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
C9orf116Q5BN46 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
C9orf116Q5BN46 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
C9orf116Q5BN46 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
C9orf116Q5BN46 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
C9orf116Q5BN46 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
C9orf116Q5BN46 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC13.36□□□□□ -0.27
C9orf116Q5BN46 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
C9orf116Q5BN46 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
C9orf116Q5BN46 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
C9orf116Q5BN46 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
C9orf116Q5BN46 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
C9orf116Q5BN46 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
C9orf116Q5BN46 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
C9orf116Q5BN46 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
C9orf116Q5BN46 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
C9orf116Q5BN46 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
C9orf116Q5BN46 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
C9orf116Q5BN46 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
C9orf116Q5BN46 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
C9orf116Q5BN46 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
C9orf116Q5BN46 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
C9orf116Q5BN46 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
C9orf116Q5BN46 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
C9orf116Q5BN46 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
C9orf116Q5BN46 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
C9orf116Q5BN46 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
C9orf116Q5BN46 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
C9orf116Q5BN46 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
C9orf116Q5BN46 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
C9orf116Q5BN46 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
C9orf116Q5BN46 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
C9orf116Q5BN46 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
C9orf116Q5BN46 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
C9orf116Q5BN46 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
C9orf116Q5BN46 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
C9orf116Q5BN46 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
C9orf116Q5BN46 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
C9orf116Q5BN46 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
C9orf116Q5BN46 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
C9orf116Q5BN46 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
C9orf116Q5BN46 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
C9orf116Q5BN46 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
C9orf116Q5BN46 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
C9orf116Q5BN46 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
C9orf116Q5BN46 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
C9orf116Q5BN46 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
C9orf116Q5BN46 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
C9orf116Q5BN46 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
C9orf116Q5BN46 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
C9orf116Q5BN46 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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