Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZIN3

TMEM259, Membralin, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM259Q4ZIN3 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
TMEM259Q4ZIN3 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMEM259Q4ZIN3 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMEM259Q4ZIN3 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMEM259Q4ZIN3 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMEM259Q4ZIN3 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMEM259Q4ZIN3 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMEM259Q4ZIN3 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMEM259Q4ZIN3 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMEM259Q4ZIN3 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMEM259Q4ZIN3 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
TMEM259Q4ZIN3 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMEM259Q4ZIN3 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMEM259Q4ZIN3 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMEM259Q4ZIN3 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMEM259Q4ZIN3 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMEM259Q4ZIN3 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMEM259Q4ZIN3 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMEM259Q4ZIN3 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
TMEM259Q4ZIN3 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMEM259Q4ZIN3 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMEM259Q4ZIN3 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMEM259Q4ZIN3 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
TMEM259Q4ZIN3 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMEM259Q4ZIN3 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMEM259Q4ZIN3 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMEM259Q4ZIN3 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMEM259Q4ZIN3 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
TMEM259Q4ZIN3 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
TMEM259Q4ZIN3 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMEM259Q4ZIN3 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMEM259Q4ZIN3 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
TMEM259Q4ZIN3 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMEM259Q4ZIN3 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMEM259Q4ZIN3 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMEM259Q4ZIN3 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMEM259Q4ZIN3 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMEM259Q4ZIN3 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMEM259Q4ZIN3 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
TMEM259Q4ZIN3 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMEM259Q4ZIN3 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMEM259Q4ZIN3 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMEM259Q4ZIN3 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMEM259Q4ZIN3 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMEM259Q4ZIN3 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMEM259Q4ZIN3 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMEM259Q4ZIN3 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMEM259Q4ZIN3 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMEM259Q4ZIN3 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMEM259Q4ZIN3 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMEM259Q4ZIN3 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMEM259Q4ZIN3 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMEM259Q4ZIN3 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMEM259Q4ZIN3 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMEM259Q4ZIN3 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMEM259Q4ZIN3 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMEM259Q4ZIN3 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMEM259Q4ZIN3 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMEM259Q4ZIN3 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMEM259Q4ZIN3 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMEM259Q4ZIN3 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMEM259Q4ZIN3 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMEM259Q4ZIN3 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMEM259Q4ZIN3 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMEM259Q4ZIN3 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMEM259Q4ZIN3 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMEM259Q4ZIN3 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMEM259Q4ZIN3 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMEM259Q4ZIN3 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMEM259Q4ZIN3 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMEM259Q4ZIN3 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMEM259Q4ZIN3 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMEM259Q4ZIN3 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMEM259Q4ZIN3 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMEM259Q4ZIN3 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMEM259Q4ZIN3 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMEM259Q4ZIN3 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMEM259Q4ZIN3 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMEM259Q4ZIN3 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMEM259Q4ZIN3 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMEM259Q4ZIN3 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMEM259Q4ZIN3 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
TMEM259Q4ZIN3 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMEM259Q4ZIN3 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMEM259Q4ZIN3 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMEM259Q4ZIN3 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMEM259Q4ZIN3 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMEM259Q4ZIN3 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMEM259Q4ZIN3 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMEM259Q4ZIN3 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TMEM259Q4ZIN3 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TMEM259Q4ZIN3 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TMEM259Q4ZIN3 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TMEM259Q4ZIN3 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TMEM259Q4ZIN3 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TMEM259Q4ZIN3 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TMEM259Q4ZIN3 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TMEM259Q4ZIN3 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TMEM259Q4ZIN3 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TMEM259Q4ZIN3 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms