Protein–RNA interactions for Protein: Q3YBR2

TBRG1, Transforming growth factor beta regulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBRG1Q3YBR2 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TBRG1Q3YBR2 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TBRG1Q3YBR2 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TBRG1Q3YBR2 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TBRG1Q3YBR2 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TBRG1Q3YBR2 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TBRG1Q3YBR2 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TBRG1Q3YBR2 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TBRG1Q3YBR2 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
TBRG1Q3YBR2 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TBRG1Q3YBR2 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TBRG1Q3YBR2 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TBRG1Q3YBR2 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TBRG1Q3YBR2 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TBRG1Q3YBR2 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TBRG1Q3YBR2 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TBRG1Q3YBR2 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TBRG1Q3YBR2 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TBRG1Q3YBR2 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TBRG1Q3YBR2 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TBRG1Q3YBR2 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TBRG1Q3YBR2 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TBRG1Q3YBR2 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TBRG1Q3YBR2 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TBRG1Q3YBR2 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TBRG1Q3YBR2 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TBRG1Q3YBR2 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TBRG1Q3YBR2 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TBRG1Q3YBR2 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TBRG1Q3YBR2 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TBRG1Q3YBR2 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TBRG1Q3YBR2 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TBRG1Q3YBR2 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TBRG1Q3YBR2 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TBRG1Q3YBR2 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TBRG1Q3YBR2 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TBRG1Q3YBR2 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TBRG1Q3YBR2 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
TBRG1Q3YBR2 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
TBRG1Q3YBR2 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TBRG1Q3YBR2 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TBRG1Q3YBR2 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TBRG1Q3YBR2 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TBRG1Q3YBR2 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TBRG1Q3YBR2 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TBRG1Q3YBR2 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TBRG1Q3YBR2 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TBRG1Q3YBR2 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TBRG1Q3YBR2 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TBRG1Q3YBR2 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TBRG1Q3YBR2 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TBRG1Q3YBR2 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TBRG1Q3YBR2 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
TBRG1Q3YBR2 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TBRG1Q3YBR2 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TBRG1Q3YBR2 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TBRG1Q3YBR2 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TBRG1Q3YBR2 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TBRG1Q3YBR2 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TBRG1Q3YBR2 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TBRG1Q3YBR2 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TBRG1Q3YBR2 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TBRG1Q3YBR2 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TBRG1Q3YBR2 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TBRG1Q3YBR2 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TBRG1Q3YBR2 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TBRG1Q3YBR2 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TBRG1Q3YBR2 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TBRG1Q3YBR2 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TBRG1Q3YBR2 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TBRG1Q3YBR2 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TBRG1Q3YBR2 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TBRG1Q3YBR2 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TBRG1Q3YBR2 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TBRG1Q3YBR2 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TBRG1Q3YBR2 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TBRG1Q3YBR2 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TBRG1Q3YBR2 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TBRG1Q3YBR2 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TBRG1Q3YBR2 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TBRG1Q3YBR2 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TBRG1Q3YBR2 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TBRG1Q3YBR2 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TBRG1Q3YBR2 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TBRG1Q3YBR2 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TBRG1Q3YBR2 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TBRG1Q3YBR2 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TBRG1Q3YBR2 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TBRG1Q3YBR2 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TBRG1Q3YBR2 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TBRG1Q3YBR2 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TBRG1Q3YBR2 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TBRG1Q3YBR2 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TBRG1Q3YBR2 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TBRG1Q3YBR2 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TBRG1Q3YBR2 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TBRG1Q3YBR2 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TBRG1Q3YBR2 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TBRG1Q3YBR2 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TBRG1Q3YBR2 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms