Protein–RNA interactions for Protein: Q3B726

TWISTNB, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWISTNBQ3B726 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TWISTNBQ3B726 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TWISTNBQ3B726 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TWISTNBQ3B726 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TWISTNBQ3B726 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TWISTNBQ3B726 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TWISTNBQ3B726 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TWISTNBQ3B726 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TWISTNBQ3B726 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TWISTNBQ3B726 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TWISTNBQ3B726 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TWISTNBQ3B726 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TWISTNBQ3B726 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TWISTNBQ3B726 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TWISTNBQ3B726 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TWISTNBQ3B726 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TWISTNBQ3B726 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TWISTNBQ3B726 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TWISTNBQ3B726 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TWISTNBQ3B726 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TWISTNBQ3B726 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TWISTNBQ3B726 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
TWISTNBQ3B726 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TWISTNBQ3B726 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
TWISTNBQ3B726 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TWISTNBQ3B726 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TWISTNBQ3B726 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TWISTNBQ3B726 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TWISTNBQ3B726 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TWISTNBQ3B726 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TWISTNBQ3B726 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TWISTNBQ3B726 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TWISTNBQ3B726 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TWISTNBQ3B726 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TWISTNBQ3B726 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TWISTNBQ3B726 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
TWISTNBQ3B726 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TWISTNBQ3B726 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TWISTNBQ3B726 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
TWISTNBQ3B726 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TWISTNBQ3B726 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TWISTNBQ3B726 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
TWISTNBQ3B726 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TWISTNBQ3B726 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TWISTNBQ3B726 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TWISTNBQ3B726 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TWISTNBQ3B726 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TWISTNBQ3B726 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TWISTNBQ3B726 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TWISTNBQ3B726 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TWISTNBQ3B726 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TWISTNBQ3B726 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TWISTNBQ3B726 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TWISTNBQ3B726 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TWISTNBQ3B726 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TWISTNBQ3B726 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TWISTNBQ3B726 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TWISTNBQ3B726 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TWISTNBQ3B726 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TWISTNBQ3B726 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TWISTNBQ3B726 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TWISTNBQ3B726 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
TWISTNBQ3B726 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TWISTNBQ3B726 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TWISTNBQ3B726 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TWISTNBQ3B726 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TWISTNBQ3B726 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
TWISTNBQ3B726 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
TWISTNBQ3B726 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
TWISTNBQ3B726 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
TWISTNBQ3B726 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
TWISTNBQ3B726 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
TWISTNBQ3B726 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TWISTNBQ3B726 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TWISTNBQ3B726 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TWISTNBQ3B726 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TWISTNBQ3B726 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
TWISTNBQ3B726 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TWISTNBQ3B726 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TWISTNBQ3B726 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TWISTNBQ3B726 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
TWISTNBQ3B726 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TWISTNBQ3B726 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TWISTNBQ3B726 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TWISTNBQ3B726 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TWISTNBQ3B726 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TWISTNBQ3B726 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TWISTNBQ3B726 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TWISTNBQ3B726 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
TWISTNBQ3B726 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TWISTNBQ3B726 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TWISTNBQ3B726 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TWISTNBQ3B726 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TWISTNBQ3B726 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TWISTNBQ3B726 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TWISTNBQ3B726 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TWISTNBQ3B726 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TWISTNBQ3B726 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TWISTNBQ3B726 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TWISTNBQ3B726 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms