Protein–RNA interactions for Protein: Q14050

COL9A3, Collagen alpha-3(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 684 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A3Q14050 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
COL9A3Q14050 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
COL9A3Q14050 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
COL9A3Q14050 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
COL9A3Q14050 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
COL9A3Q14050 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
COL9A3Q14050 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
COL9A3Q14050 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
COL9A3Q14050 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
COL9A3Q14050 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
COL9A3Q14050 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
COL9A3Q14050 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
COL9A3Q14050 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
COL9A3Q14050 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
COL9A3Q14050 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
COL9A3Q14050 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
COL9A3Q14050 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
COL9A3Q14050 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
COL9A3Q14050 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
COL9A3Q14050 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
COL9A3Q14050 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
COL9A3Q14050 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
COL9A3Q14050 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
COL9A3Q14050 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
COL9A3Q14050 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
COL9A3Q14050 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
COL9A3Q14050 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
COL9A3Q14050 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
COL9A3Q14050 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
COL9A3Q14050 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
COL9A3Q14050 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
COL9A3Q14050 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
COL9A3Q14050 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
COL9A3Q14050 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
COL9A3Q14050 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
COL9A3Q14050 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
COL9A3Q14050 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
COL9A3Q14050 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
COL9A3Q14050 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
COL9A3Q14050 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
COL9A3Q14050 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
COL9A3Q14050 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
COL9A3Q14050 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
COL9A3Q14050 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
COL9A3Q14050 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
COL9A3Q14050 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
COL9A3Q14050 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
COL9A3Q14050 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
COL9A3Q14050 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
COL9A3Q14050 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
COL9A3Q14050 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
COL9A3Q14050 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
COL9A3Q14050 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
COL9A3Q14050 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
COL9A3Q14050 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
COL9A3Q14050 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
COL9A3Q14050 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
COL9A3Q14050 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
COL9A3Q14050 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
COL9A3Q14050 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
COL9A3Q14050 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
COL9A3Q14050 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
COL9A3Q14050 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
COL9A3Q14050 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
COL9A3Q14050 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
COL9A3Q14050 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
COL9A3Q14050 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
COL9A3Q14050 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
COL9A3Q14050 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
COL9A3Q14050 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
COL9A3Q14050 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
COL9A3Q14050 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
COL9A3Q14050 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
COL9A3Q14050 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
COL9A3Q14050 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
COL9A3Q14050 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC23.82■■□□□ 1.4
COL9A3Q14050 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
COL9A3Q14050 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
COL9A3Q14050 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
COL9A3Q14050 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
COL9A3Q14050 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
COL9A3Q14050 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
COL9A3Q14050 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
COL9A3Q14050 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
COL9A3Q14050 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
COL9A3Q14050 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
COL9A3Q14050 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
COL9A3Q14050 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC23.81■■□□□ 1.4
COL9A3Q14050 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
COL9A3Q14050 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
COL9A3Q14050 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
COL9A3Q14050 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
COL9A3Q14050 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
COL9A3Q14050 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
COL9A3Q14050 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
COL9A3Q14050 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
COL9A3Q14050 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
COL9A3Q14050 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
COL9A3Q14050 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
COL9A3Q14050 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
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