Protein–RNA interactions for Protein: Q14028

CNGB1, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,251 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB1Q14028 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CNGB1Q14028 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CNGB1Q14028 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CNGB1Q14028 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CNGB1Q14028 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CNGB1Q14028 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CNGB1Q14028 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CNGB1Q14028 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CNGB1Q14028 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CNGB1Q14028 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CNGB1Q14028 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
CNGB1Q14028 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CNGB1Q14028 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CNGB1Q14028 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CNGB1Q14028 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CNGB1Q14028 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CNGB1Q14028 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CNGB1Q14028 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CNGB1Q14028 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CNGB1Q14028 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CNGB1Q14028 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CNGB1Q14028 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CNGB1Q14028 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CNGB1Q14028 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
CNGB1Q14028 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
CNGB1Q14028 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CNGB1Q14028 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CNGB1Q14028 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CNGB1Q14028 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CNGB1Q14028 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CNGB1Q14028 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CNGB1Q14028 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CNGB1Q14028 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CNGB1Q14028 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CNGB1Q14028 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CNGB1Q14028 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CNGB1Q14028 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CNGB1Q14028 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CNGB1Q14028 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
CNGB1Q14028 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC27.83■■■□□ 2.05
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CNGB1Q14028 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
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CNGB1Q14028 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
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CNGB1Q14028 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CNGB1Q14028 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
CNGB1Q14028 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
CNGB1Q14028 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
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CNGB1Q14028 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
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CNGB1Q14028 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CNGB1Q14028 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
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CNGB1Q14028 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
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CNGB1Q14028 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CNGB1Q14028 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
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CNGB1Q14028 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
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CNGB1Q14028 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CNGB1Q14028 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CNGB1Q14028 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CNGB1Q14028 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CNGB1Q14028 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CNGB1Q14028 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CNGB1Q14028 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CNGB1Q14028 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CNGB1Q14028 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CNGB1Q14028 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CNGB1Q14028 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CNGB1Q14028 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CNGB1Q14028 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CNGB1Q14028 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CNGB1Q14028 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CNGB1Q14028 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CNGB1Q14028 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CNGB1Q14028 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CNGB1Q14028 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CNGB1Q14028 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CNGB1Q14028 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CNGB1Q14028 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
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