Protein–RNA interactions for Protein: Q13939

CCIN, Calicin, humanhuman

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Length 588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCINQ13939 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCINQ13939 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCINQ13939 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCINQ13939 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCINQ13939 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCINQ13939 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCINQ13939 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCINQ13939 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCINQ13939 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCINQ13939 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCINQ13939 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCINQ13939 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCINQ13939 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCINQ13939 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CCINQ13939 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCINQ13939 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCINQ13939 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCINQ13939 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCINQ13939 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCINQ13939 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCINQ13939 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCINQ13939 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCINQ13939 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCINQ13939 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCINQ13939 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCINQ13939 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCINQ13939 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCINQ13939 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CCINQ13939 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCINQ13939 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCINQ13939 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCINQ13939 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CCINQ13939 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCINQ13939 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCINQ13939 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCINQ13939 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCINQ13939 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCINQ13939 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCINQ13939 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCINQ13939 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCINQ13939 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
CCINQ13939 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCINQ13939 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCINQ13939 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCINQ13939 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCINQ13939 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCINQ13939 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCINQ13939 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCINQ13939 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCINQ13939 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
CCINQ13939 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
CCINQ13939 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
CCINQ13939 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
CCINQ13939 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCINQ13939 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCINQ13939 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCINQ13939 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCINQ13939 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCINQ13939 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCINQ13939 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCINQ13939 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCINQ13939 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCINQ13939 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCINQ13939 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCINQ13939 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCINQ13939 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCINQ13939 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCINQ13939 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCINQ13939 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
CCINQ13939 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
CCINQ13939 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCINQ13939 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCINQ13939 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CCINQ13939 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CCINQ13939 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CCINQ13939 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CCINQ13939 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCINQ13939 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCINQ13939 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCINQ13939 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCINQ13939 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCINQ13939 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCINQ13939 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCINQ13939 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCINQ13939 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCINQ13939 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCINQ13939 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCINQ13939 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCINQ13939 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCINQ13939 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCINQ13939 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
CCINQ13939 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCINQ13939 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCINQ13939 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCINQ13939 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCINQ13939 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCINQ13939 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
CCINQ13939 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCINQ13939 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCINQ13939 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
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