Protein–RNA interactions for Protein: Q02785

PDR12, ATP-dependent permease PDR12, yeastyeast

Predictions only

Length 1,511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PDR12Q02785 YBR062CYBR062C 543 nt-0.68□□□□□ -2.52
PDR12Q02785 YBR206WYBR206W 324 nt-0.69□□□□□ -2.52
PDR12Q02785 RFX1YLR176C 2436 nt-0.69□□□□□ -2.52
PDR12Q02785 CHZ1YER030W 462 nt-0.7□□□□□ -2.52
PDR12Q02785 YLR252WYLR252W 306 nt-0.7□□□□□ -2.52
PDR12Q02785 YOR186C-AYOR186C-A 210 nt-0.7□□□□□ -2.52
PDR12Q02785 YEL010WYEL010W 351 nt-0.71□□□□□ -2.52
PDR12Q02785 YGR042WYGR042W 816 nt-0.71□□□□□ -2.52
PDR12Q02785 YNR021WYNR021W 1215 nt-0.71□□□□□ -2.52
PDR12Q02785 ERV15YBR210W 429 nt-0.71□□□□□ -2.52
PDR12Q02785 REF2YDR195W 1602 nt-0.72□□□□□ -2.52
PDR12Q02785 ARP9YMR033W 1404 nt-0.73□□□□□ -2.53
PDR12Q02785 ORC3YLL004W 1851 nt-0.73□□□□□ -2.53
PDR12Q02785 PCL2YDL127W 927 nt-0.74□□□□□ -2.53
PDR12Q02785 MMS4YBR098W 2076 nt-0.74□□□□□ -2.53
PDR12Q02785 SCW11YGL028C 1629 nt-0.74□□□□□ -2.53
PDR12Q02785 YCR022CYCR022C 345 nt-0.74□□□□□ -2.53
PDR12Q02785 HNT1YDL125C 477 nt-0.74□□□□□ -2.53
PDR12Q02785 YLR101CYLR101C 396 nt-0.74□□□□□ -2.53
PDR12Q02785 YNL150WYNL150W 408 nt-0.74□□□□□ -2.53
PDR12Q02785 tT(UGU)G1tT(UGU)G1 72 nt-0.75□□□□□ -2.53
PDR12Q02785 tT(UGU)G2tT(UGU)G2 72 nt-0.75□□□□□ -2.53
PDR12Q02785 tT(UGU)PtT(UGU)P 72 nt-0.75□□□□□ -2.53
PDR12Q02785 YIR018C-AYIR018C-A 138 nt-0.76□□□□□ -2.53
PDR12Q02785 YIM2YMR151W 438 nt-0.76□□□□□ -2.53
PDR12Q02785 SPO23YBR250W 1572 nt-0.76□□□□□ -2.53
PDR12Q02785 DAD1YDR016C 285 nt-0.77□□□□□ -2.53
PDR12Q02785 TIM13YGR181W 318 nt-0.77□□□□□ -2.53
PDR12Q02785 YCR038W-AYCR038W-A 126 nt-0.79□□□□□ -2.54
PDR12Q02785 YHR139C-AYHR139C-A 312 nt-0.79□□□□□ -2.54
PDR12Q02785 YCL002CYCL002C 792 nt-0.79□□□□□ -2.54
PDR12Q02785 SST2YLR452C 2097 nt-0.79□□□□□ -2.54
PDR12Q02785 TIM10YHR005C-A 282 nt-0.79□□□□□ -2.54
PDR12Q02785 YNL211CYNL211C 261 nt-0.79□□□□□ -2.54
PDR12Q02785 SWM2YNR004W 441 nt-0.79□□□□□ -2.54
PDR12Q02785 MUM2YBR057C 1101 nt-0.79□□□□□ -2.54
PDR12Q02785 YDR371C-AYDR371C-A 105 nt-0.8□□□□□ -2.54
PDR12Q02785 SPO11YHL022C 1197 nt-0.82□□□□□ -2.54
PDR12Q02785 YJL156W-AYJL156W-A 222 nt-0.82□□□□□ -2.54
PDR12Q02785 snR128snR128 126 nt-0.82□□□□□ -2.54
PDR12Q02785 KAR1YNL188W 1302 nt-0.82□□□□□ -2.54
PDR12Q02785 LEE1YPL054W 906 nt-0.83□□□□□ -2.54
PDR12Q02785 VAB2YEL005C 849 nt-0.84□□□□□ -2.54
PDR12Q02785 YHL042WYHL042W 453 nt-0.84□□□□□ -2.54
PDR12Q02785 RPS16AYMR143W 432 nt-0.84□□□□□ -2.54
PDR12Q02785 LCD1YDR499W 2244 nt-0.84□□□□□ -2.54
PDR12Q02785 PTP2YOR208W 2253 nt-0.84□□□□□ -2.54
PDR12Q02785 YDR029WYDR029W 315 nt-0.85□□□□□ -2.55
PDR12Q02785 GIC2YDR309C 1152 nt-0.85□□□□□ -2.55
PDR12Q02785 COX5BYIL111W 456 nt-0.85□□□□□ -2.55
PDR12Q02785 BSC3YLR465C 309 nt-0.85□□□□□ -2.55
PDR12Q02785 RTC6YPL183W-A 282 nt-0.85□□□□□ -2.55
PDR12Q02785 SRP14YDL092W 441 nt-0.86□□□□□ -2.55
PDR12Q02785 MMS2YGL087C 414 nt-0.86□□□□□ -2.55
PDR12Q02785 RPS26AYGL189C 360 nt-0.87□□□□□ -2.55
PDR12Q02785 RPS7BYNL096C 573 nt-0.87□□□□□ -2.55
PDR12Q02785 YOP1YPR028W 543 nt-0.87□□□□□ -2.55
PDR12Q02785 VPS28YPL065W 729 nt-0.88□□□□□ -2.55
PDR12Q02785 UPS1YLR193C 528 nt-0.89□□□□□ -2.55
PDR12Q02785 AI5_ALPHAQ0070 1893 nt-0.9□□□□□ -2.55
PDR12Q02785 OLI1Q0130 231 nt-0.9□□□□□ -2.55
PDR12Q02785 MRPL24YMR193W 777 nt-0.9□□□□□ -2.55
PDR12Q02785 NIP1YMR309C 2439 nt-0.92□□□□□ -2.56
PDR12Q02785 CRG1YHR209W 876 nt-0.92□□□□□ -2.56
PDR12Q02785 IST3YIR005W 447 nt-0.92□□□□□ -2.56
PDR12Q02785 RRT1YBL048W 312 nt-0.92□□□□□ -2.56
PDR12Q02785 YKU70YMR284W 1809 nt-0.92□□□□□ -2.56
PDR12Q02785 YDL009CYDL009C 324 nt-0.93□□□□□ -2.56
PDR12Q02785 AI4Q0065 1671 nt-0.93□□□□□ -2.56
PDR12Q02785 ATX1YNL259C 222 nt-0.94□□□□□ -2.56
PDR12Q02785 YBR223W-AYBR223W-A 120 nt-0.94□□□□□ -2.56
PDR12Q02785 MAM33YIL070C 801 nt-0.94□□□□□ -2.56
PDR12Q02785 MCM10YIL150C 1716 nt-0.95□□□□□ -2.56
PDR12Q02785 RPL42BYHR141C 321 nt-0.95□□□□□ -2.56
PDR12Q02785 YJR141WYJR141W 1044 nt-0.95□□□□□ -2.56
PDR12Q02785 HTB2YBL002W 396 nt-0.95□□□□□ -2.56
PDR12Q02785 RPL42AYNL162W 321 nt-0.95□□□□□ -2.56
PDR12Q02785 COY1YKL179C 2040 nt-0.96□□□□□ -2.56
PDR12Q02785 AEP1YMR064W 1557 nt-0.96□□□□□ -2.56
PDR12Q02785 YDR114CYDR114C 303 nt-0.96□□□□□ -2.56
PDR12Q02785 GEP7YGL057C 864 nt-0.96□□□□□ -2.56
PDR12Q02785 YAL069WYAL069W 315 nt-0.96□□□□□ -2.56
PDR12Q02785 YLR311CYLR311C 348 nt-0.96□□□□□ -2.56
PDR12Q02785 ECM9YKR004C 1134 nt-0.97□□□□□ -2.56
PDR12Q02785 CSM4YPL200W 471 nt-0.97□□□□□ -2.56
PDR12Q02785 ZIP1YDR285W 2628 nt-0.97□□□□□ -2.57
PDR12Q02785 OST4YDL232W 111 nt-0.99□□□□□ -2.57
PDR12Q02785 YER038W-AYER038W-A 381 nt-0.99□□□□□ -2.57
PDR12Q02785 YHR028W-AYHR028W-A 321 nt-0.99□□□□□ -2.57
PDR12Q02785 YKE2YLR200W 345 nt-0.99□□□□□ -2.57
PDR12Q02785 YNL146WYNL146W 303 nt-0.99□□□□□ -2.57
PDR12Q02785 ASE1YOR058C 2658 nt-0.99□□□□□ -2.57
PDR12Q02785 YDR344CYDR344C 444 nt-0.99□□□□□ -2.57
PDR12Q02785 YML047W-AYML047W-A 366 nt-0.99□□□□□ -2.57
PDR12Q02785 YOL118CYOL118C 309 nt-0.99□□□□□ -2.57
PDR12Q02785 snR161snR161 161 nt-0.99□□□□□ -2.57
PDR12Q02785 YBR184WYBR184W 1572 nt-1□□□□□ -2.57
PDR12Q02785 YPR074W-AYPR074W-A 171 nt-1□□□□□ -2.57
PDR12Q02785 DIE2YGR227W 1578 nt-1.01□□□□□ -2.57
PDR12Q02785 YDR182W-AYDR182W-A 204 nt-1.01□□□□□ -2.57
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 857.2 ms