Protein–RNA interactions for Protein: Q01668

CACNA1D, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1D, humanhuman

Predictions only

Length 2,161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1DQ01668 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CACNA1DQ01668 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CACNA1DQ01668 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNA1DQ01668 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNA1DQ01668 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNA1DQ01668 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNA1DQ01668 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNA1DQ01668 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNA1DQ01668 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNA1DQ01668 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNA1DQ01668 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNA1DQ01668 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNA1DQ01668 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNA1DQ01668 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNA1DQ01668 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNA1DQ01668 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNA1DQ01668 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNA1DQ01668 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNA1DQ01668 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNA1DQ01668 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNA1DQ01668 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNA1DQ01668 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNA1DQ01668 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNA1DQ01668 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNA1DQ01668 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNA1DQ01668 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNA1DQ01668 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNA1DQ01668 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNA1DQ01668 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CACNA1DQ01668 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CACNA1DQ01668 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CACNA1DQ01668 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CACNA1DQ01668 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CACNA1DQ01668 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CACNA1DQ01668 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CACNA1DQ01668 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CACNA1DQ01668 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CACNA1DQ01668 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CACNA1DQ01668 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CACNA1DQ01668 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CACNA1DQ01668 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CACNA1DQ01668 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CACNA1DQ01668 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CACNA1DQ01668 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CACNA1DQ01668 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CACNA1DQ01668 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CACNA1DQ01668 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CACNA1DQ01668 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CACNA1DQ01668 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CACNA1DQ01668 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CACNA1DQ01668 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CACNA1DQ01668 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CACNA1DQ01668 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CACNA1DQ01668 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CACNA1DQ01668 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CACNA1DQ01668 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CACNA1DQ01668 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CACNA1DQ01668 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CACNA1DQ01668 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CACNA1DQ01668 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CACNA1DQ01668 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CACNA1DQ01668 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CACNA1DQ01668 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CACNA1DQ01668 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CACNA1DQ01668 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CACNA1DQ01668 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CACNA1DQ01668 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CACNA1DQ01668 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CACNA1DQ01668 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CACNA1DQ01668 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CACNA1DQ01668 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CACNA1DQ01668 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CACNA1DQ01668 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CACNA1DQ01668 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CACNA1DQ01668 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CACNA1DQ01668 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CACNA1DQ01668 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CACNA1DQ01668 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CACNA1DQ01668 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CACNA1DQ01668 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CACNA1DQ01668 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
CACNA1DQ01668 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CACNA1DQ01668 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CACNA1DQ01668 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CACNA1DQ01668 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CACNA1DQ01668 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CACNA1DQ01668 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CACNA1DQ01668 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CACNA1DQ01668 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CACNA1DQ01668 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CACNA1DQ01668 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CACNA1DQ01668 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CACNA1DQ01668 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CACNA1DQ01668 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CACNA1DQ01668 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CACNA1DQ01668 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CACNA1DQ01668 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CACNA1DQ01668 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CACNA1DQ01668 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CACNA1DQ01668 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.7 ms