Protein–RNA interactions for Protein: P98174

FGD1, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD1P98174 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
FGD1P98174 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
FGD1P98174 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FGD1P98174 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
FGD1P98174 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FGD1P98174 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
FGD1P98174 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FGD1P98174 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
FGD1P98174 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
FGD1P98174 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
FGD1P98174 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FGD1P98174 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FGD1P98174 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FGD1P98174 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FGD1P98174 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
FGD1P98174 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
FGD1P98174 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
FGD1P98174 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FGD1P98174 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
FGD1P98174 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FGD1P98174 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FGD1P98174 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
FGD1P98174 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FGD1P98174 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FGD1P98174 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FGD1P98174 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FGD1P98174 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FGD1P98174 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
FGD1P98174 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FGD1P98174 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
FGD1P98174 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
FGD1P98174 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
FGD1P98174 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
FGD1P98174 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
FGD1P98174 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FGD1P98174 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FGD1P98174 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
FGD1P98174 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
FGD1P98174 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
FGD1P98174 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
FGD1P98174 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
FGD1P98174 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
FGD1P98174 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
FGD1P98174 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
FGD1P98174 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
FGD1P98174 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FGD1P98174 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
FGD1P98174 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
FGD1P98174 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FGD1P98174 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FGD1P98174 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FGD1P98174 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FGD1P98174 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
FGD1P98174 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FGD1P98174 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
FGD1P98174 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
FGD1P98174 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
FGD1P98174 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FGD1P98174 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FGD1P98174 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
FGD1P98174 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
FGD1P98174 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FGD1P98174 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FGD1P98174 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FGD1P98174 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FGD1P98174 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
FGD1P98174 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
FGD1P98174 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
FGD1P98174 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FGD1P98174 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FGD1P98174 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FGD1P98174 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FGD1P98174 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FGD1P98174 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FGD1P98174 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FGD1P98174 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FGD1P98174 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
FGD1P98174 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FGD1P98174 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FGD1P98174 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FGD1P98174 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FGD1P98174 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FGD1P98174 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FGD1P98174 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
FGD1P98174 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FGD1P98174 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FGD1P98174 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FGD1P98174 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FGD1P98174 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
FGD1P98174 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
FGD1P98174 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
FGD1P98174 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FGD1P98174 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FGD1P98174 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FGD1P98174 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
FGD1P98174 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FGD1P98174 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FGD1P98174 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
FGD1P98174 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
FGD1P98174 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms