Protein–RNA interactions for Protein: P59894

DCDC1, Doublecortin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCDC1P59894 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
DCDC1P59894 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
DCDC1P59894 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
DCDC1P59894 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
DCDC1P59894 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
DCDC1P59894 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
DCDC1P59894 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
DCDC1P59894 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
DCDC1P59894 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
DCDC1P59894 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC20■□□□□ 0.79
DCDC1P59894 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
DCDC1P59894 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
DCDC1P59894 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC20■□□□□ 0.79
DCDC1P59894 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
DCDC1P59894 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
DCDC1P59894 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
DCDC1P59894 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
DCDC1P59894 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
DCDC1P59894 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
DCDC1P59894 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
DCDC1P59894 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
DCDC1P59894 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
DCDC1P59894 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
DCDC1P59894 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
DCDC1P59894 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
DCDC1P59894 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
DCDC1P59894 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
DCDC1P59894 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
DCDC1P59894 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
DCDC1P59894 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
DCDC1P59894 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
DCDC1P59894 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
DCDC1P59894 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
DCDC1P59894 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
DCDC1P59894 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
DCDC1P59894 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
DCDC1P59894 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
DCDC1P59894 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
DCDC1P59894 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
DCDC1P59894 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
DCDC1P59894 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
DCDC1P59894 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
DCDC1P59894 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
DCDC1P59894 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
DCDC1P59894 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
DCDC1P59894 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
DCDC1P59894 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
DCDC1P59894 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
DCDC1P59894 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
DCDC1P59894 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
DCDC1P59894 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
DCDC1P59894 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
DCDC1P59894 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
DCDC1P59894 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
DCDC1P59894 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
DCDC1P59894 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
DCDC1P59894 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
DCDC1P59894 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
DCDC1P59894 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
DCDC1P59894 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
DCDC1P59894 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
DCDC1P59894 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
DCDC1P59894 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
DCDC1P59894 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
DCDC1P59894 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
DCDC1P59894 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
DCDC1P59894 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
DCDC1P59894 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
DCDC1P59894 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
DCDC1P59894 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
DCDC1P59894 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
DCDC1P59894 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
DCDC1P59894 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
DCDC1P59894 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
DCDC1P59894 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
DCDC1P59894 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
DCDC1P59894 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
DCDC1P59894 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
DCDC1P59894 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
DCDC1P59894 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
DCDC1P59894 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
DCDC1P59894 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
DCDC1P59894 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
DCDC1P59894 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
DCDC1P59894 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
DCDC1P59894 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
DCDC1P59894 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
DCDC1P59894 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
DCDC1P59894 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
DCDC1P59894 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
DCDC1P59894 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
DCDC1P59894 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
DCDC1P59894 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
DCDC1P59894 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
DCDC1P59894 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
DCDC1P59894 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
DCDC1P59894 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
DCDC1P59894 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
DCDC1P59894 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
DCDC1P59894 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms