Protein–RNA interactions for Protein: P55160

NCKAP1L, Nck-associated protein 1-like, humanhuman

Predictions only

Length 1,127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCKAP1LP55160 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
NCKAP1LP55160 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
NCKAP1LP55160 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NCKAP1LP55160 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NCKAP1LP55160 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NCKAP1LP55160 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NCKAP1LP55160 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NCKAP1LP55160 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NCKAP1LP55160 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NCKAP1LP55160 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NCKAP1LP55160 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NCKAP1LP55160 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NCKAP1LP55160 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NCKAP1LP55160 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NCKAP1LP55160 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NCKAP1LP55160 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NCKAP1LP55160 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NCKAP1LP55160 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NCKAP1LP55160 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NCKAP1LP55160 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NCKAP1LP55160 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NCKAP1LP55160 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NCKAP1LP55160 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NCKAP1LP55160 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NCKAP1LP55160 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
NCKAP1LP55160 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NCKAP1LP55160 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NCKAP1LP55160 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NCKAP1LP55160 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NCKAP1LP55160 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NCKAP1LP55160 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NCKAP1LP55160 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NCKAP1LP55160 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NCKAP1LP55160 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NCKAP1LP55160 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NCKAP1LP55160 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NCKAP1LP55160 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NCKAP1LP55160 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NCKAP1LP55160 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NCKAP1LP55160 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NCKAP1LP55160 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NCKAP1LP55160 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NCKAP1LP55160 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NCKAP1LP55160 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NCKAP1LP55160 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NCKAP1LP55160 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NCKAP1LP55160 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NCKAP1LP55160 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
NCKAP1LP55160 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NCKAP1LP55160 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NCKAP1LP55160 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
NCKAP1LP55160 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NCKAP1LP55160 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NCKAP1LP55160 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NCKAP1LP55160 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NCKAP1LP55160 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NCKAP1LP55160 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NCKAP1LP55160 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NCKAP1LP55160 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NCKAP1LP55160 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NCKAP1LP55160 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
NCKAP1LP55160 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NCKAP1LP55160 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NCKAP1LP55160 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
NCKAP1LP55160 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NCKAP1LP55160 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NCKAP1LP55160 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NCKAP1LP55160 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NCKAP1LP55160 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NCKAP1LP55160 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NCKAP1LP55160 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NCKAP1LP55160 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NCKAP1LP55160 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NCKAP1LP55160 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NCKAP1LP55160 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NCKAP1LP55160 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NCKAP1LP55160 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
NCKAP1LP55160 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NCKAP1LP55160 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NCKAP1LP55160 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NCKAP1LP55160 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NCKAP1LP55160 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NCKAP1LP55160 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NCKAP1LP55160 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NCKAP1LP55160 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NCKAP1LP55160 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NCKAP1LP55160 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NCKAP1LP55160 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
NCKAP1LP55160 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NCKAP1LP55160 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NCKAP1LP55160 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NCKAP1LP55160 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NCKAP1LP55160 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NCKAP1LP55160 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NCKAP1LP55160 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NCKAP1LP55160 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
NCKAP1LP55160 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NCKAP1LP55160 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NCKAP1LP55160 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NCKAP1LP55160 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.8 ms