Protein–RNA interactions for Protein: P36578

RPL4, 60S ribosomal protein L4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL4P36578 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RPL4P36578 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RPL4P36578 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RPL4P36578 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RPL4P36578 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RPL4P36578 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RPL4P36578 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RPL4P36578 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RPL4P36578 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RPL4P36578 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RPL4P36578 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RPL4P36578 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RPL4P36578 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RPL4P36578 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RPL4P36578 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RPL4P36578 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RPL4P36578 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RPL4P36578 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RPL4P36578 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RPL4P36578 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RPL4P36578 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RPL4P36578 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RPL4P36578 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RPL4P36578 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RPL4P36578 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RPL4P36578 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RPL4P36578 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RPL4P36578 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RPL4P36578 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RPL4P36578 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RPL4P36578 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RPL4P36578 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RPL4P36578 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RPL4P36578 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RPL4P36578 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RPL4P36578 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RPL4P36578 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RPL4P36578 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RPL4P36578 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RPL4P36578 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RPL4P36578 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RPL4P36578 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RPL4P36578 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPL4P36578 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPL4P36578 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPL4P36578 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPL4P36578 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPL4P36578 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPL4P36578 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
RPL4P36578 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPL4P36578 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPL4P36578 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPL4P36578 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPL4P36578 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RPL4P36578 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RPL4P36578 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RPL4P36578 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RPL4P36578 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RPL4P36578 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RPL4P36578 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RPL4P36578 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RPL4P36578 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RPL4P36578 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RPL4P36578 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RPL4P36578 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RPL4P36578 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RPL4P36578 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RPL4P36578 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RPL4P36578 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RPL4P36578 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RPL4P36578 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RPL4P36578 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
RPL4P36578 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RPL4P36578 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RPL4P36578 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RPL4P36578 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RPL4P36578 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPL4P36578 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPL4P36578 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPL4P36578 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPL4P36578 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPL4P36578 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPL4P36578 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPL4P36578 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPL4P36578 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
RPL4P36578 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPL4P36578 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPL4P36578 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPL4P36578 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPL4P36578 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPL4P36578 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPL4P36578 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
RPL4P36578 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPL4P36578 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPL4P36578 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
RPL4P36578 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPL4P36578 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPL4P36578 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPL4P36578 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPL4P36578 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms