Protein–RNA interactions for Protein: P35452

HOXD12, Homeobox protein Hox-D12, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12P35452 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXD12P35452 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXD12P35452 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXD12P35452 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXD12P35452 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXD12P35452 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXD12P35452 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXD12P35452 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXD12P35452 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXD12P35452 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXD12P35452 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXD12P35452 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXD12P35452 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXD12P35452 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXD12P35452 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXD12P35452 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXD12P35452 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXD12P35452 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXD12P35452 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXD12P35452 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXD12P35452 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXD12P35452 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXD12P35452 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HOXD12P35452 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
HOXD12P35452 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
HOXD12P35452 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXD12P35452 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXD12P35452 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXD12P35452 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXD12P35452 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXD12P35452 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXD12P35452 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXD12P35452 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXD12P35452 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXD12P35452 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXD12P35452 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXD12P35452 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXD12P35452 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXD12P35452 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXD12P35452 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXD12P35452 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXD12P35452 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXD12P35452 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXD12P35452 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXD12P35452 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXD12P35452 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXD12P35452 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXD12P35452 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXD12P35452 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXD12P35452 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXD12P35452 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXD12P35452 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXD12P35452 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXD12P35452 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXD12P35452 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXD12P35452 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXD12P35452 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXD12P35452 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXD12P35452 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXD12P35452 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXD12P35452 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXD12P35452 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXD12P35452 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXD12P35452 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXD12P35452 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXD12P35452 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXD12P35452 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXD12P35452 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXD12P35452 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXD12P35452 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXD12P35452 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXD12P35452 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXD12P35452 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXD12P35452 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXD12P35452 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXD12P35452 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXD12P35452 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXD12P35452 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXD12P35452 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXD12P35452 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXD12P35452 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXD12P35452 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXD12P35452 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXD12P35452 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXD12P35452 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXD12P35452 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXD12P35452 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXD12P35452 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXD12P35452 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXD12P35452 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXD12P35452 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXD12P35452 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXD12P35452 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXD12P35452 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXD12P35452 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXD12P35452 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXD12P35452 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXD12P35452 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXD12P35452 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXD12P35452 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms