Protein–RNA interactions for Protein: P30260

CDC27, Cell division cycle protein 27 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC27P30260 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDC27P30260 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDC27P30260 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CDC27P30260 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDC27P30260 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDC27P30260 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDC27P30260 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDC27P30260 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDC27P30260 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDC27P30260 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDC27P30260 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDC27P30260 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDC27P30260 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDC27P30260 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDC27P30260 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDC27P30260 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDC27P30260 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDC27P30260 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDC27P30260 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDC27P30260 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDC27P30260 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDC27P30260 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CDC27P30260 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CDC27P30260 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CDC27P30260 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CDC27P30260 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CDC27P30260 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDC27P30260 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDC27P30260 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDC27P30260 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDC27P30260 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CDC27P30260 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDC27P30260 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDC27P30260 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDC27P30260 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDC27P30260 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CDC27P30260 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDC27P30260 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CDC27P30260 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDC27P30260 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDC27P30260 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDC27P30260 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDC27P30260 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDC27P30260 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDC27P30260 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDC27P30260 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDC27P30260 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDC27P30260 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDC27P30260 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDC27P30260 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDC27P30260 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CDC27P30260 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDC27P30260 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDC27P30260 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDC27P30260 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDC27P30260 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDC27P30260 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDC27P30260 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CDC27P30260 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDC27P30260 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDC27P30260 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDC27P30260 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDC27P30260 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDC27P30260 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDC27P30260 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDC27P30260 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDC27P30260 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDC27P30260 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDC27P30260 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDC27P30260 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDC27P30260 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDC27P30260 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDC27P30260 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CDC27P30260 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDC27P30260 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDC27P30260 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDC27P30260 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDC27P30260 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDC27P30260 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDC27P30260 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDC27P30260 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDC27P30260 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDC27P30260 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CDC27P30260 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDC27P30260 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDC27P30260 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDC27P30260 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDC27P30260 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDC27P30260 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDC27P30260 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDC27P30260 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDC27P30260 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDC27P30260 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDC27P30260 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDC27P30260 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDC27P30260 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDC27P30260 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDC27P30260 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDC27P30260 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDC27P30260 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms