Protein–RNA interactions for Protein: P17883

SKI3, Superkiller protein 3, yeast

Known RBP Predictions only

Length 1,432 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SKI3	P17883	snR84	snR84	550 nt		-0.6	□□□□□ -2.51
SKI3	P17883	RAD6	YGL058W	519 nt		-0.6	□□□□□ -2.51
SKI3	P17883	VMA21	YGR105W	234 nt		-0.61	□□□□□ -2.51
SKI3	P17883	MRPL24	YMR193W	777 nt		-0.61	□□□□□ -2.51
SKI3	P17883	MMS4	YBR098W	2076 nt		-0.62	□□□□□ -2.51
SKI3	P17883	YJL127W-A	YJL127W-A	117 nt		-0.63	□□□□□ -2.51
SKI3	P17883	YER046W-A	YER046W-A	330 nt		-0.64	□□□□□ -2.51
SKI3	P17883	SCW11	YGL028C	1629 nt		-0.65	□□□□□ -2.51
SKI3	P17883	NTF2	YER009W	378 nt		-0.65	□□□□□ -2.51
SKI3	P17883	NPC2	YDL046W	522 nt		-0.66	□□□□□ -2.52
SKI3	P17883	YPL080C	YPL080C	327 nt		-0.66	□□□□□ -2.52
SKI3	P17883	SUT2	YPR009W	807 nt		-0.67	□□□□□ -2.52
SKI3	P17883	YBR206W	YBR206W	324 nt		-0.67	□□□□□ -2.52
SKI3	P17883	CRG1	YHR209W	876 nt		-0.68	□□□□□ -2.52
SKI3	P17883	EFR3	YMR212C	2349 nt		-0.68	□□□□□ -2.52
SKI3	P17883	RCO1	YMR075W	2055 nt		-0.69	□□□□□ -2.52
SKI3	P17883	SLD5	YDR489W	885 nt		-0.69	□□□□□ -2.52
SKI3	P17883	YJL032W	YJL032W	315 nt		-0.69	□□□□□ -2.52
SKI3	P17883	CUL3	YGR003W	2235 nt		-0.69	□□□□□ -2.52
SKI3	P17883	RPM2	YML091C	3609 nt		-0.69	□□□□□ -2.52
SKI3	P17883	ARP9	YMR033W	1404 nt		-0.7	□□□□□ -2.52
SKI3	P17883	SBH2	YER019C-A	267 nt		-0.7	□□□□□ -2.52
SKI3	P17883	YNR077C	YNR077C	255 nt		-0.7	□□□□□ -2.52
SKI3	P17883	EMC4	YGL231C	573 nt		-0.71	□□□□□ -2.52
SKI3	P17883	YIR030W-A	YIR030W-A	384 nt		-0.72	□□□□□ -2.52
SKI3	P17883	REF2	YDR195W	1602 nt		-0.72	□□□□□ -2.52
SKI3	P17883	YEL010W	YEL010W	351 nt		-0.72	□□□□□ -2.53
SKI3	P17883	MIC19	YFR011C	513 nt		-0.72	□□□□□ -2.53
SKI3	P17883	CCE1	YKL011C	1062 nt		-0.72	□□□□□ -2.53
SKI3	P17883	RFX1	YLR176C	2436 nt		-0.73	□□□□□ -2.53
SKI3	P17883	YGR042W	YGR042W	816 nt		-0.73	□□□□□ -2.53
SKI3	P17883	YLR252W	YLR252W	306 nt		-0.73	□□□□□ -2.53
SKI3	P17883	FAR3	YMR052W	615 nt		-0.73	□□□□□ -2.53
SKI3	P17883	ERV15	YBR210W	429 nt		-0.73	□□□□□ -2.53
SKI3	P17883	KAR1	YNL188W	1302 nt		-0.74	□□□□□ -2.53
SKI3	P17883	SRP14	YDL092W	441 nt		-0.74	□□□□□ -2.53
SKI3	P17883	YCR022C	YCR022C	345 nt		-0.75	□□□□□ -2.53
SKI3	P17883	PHO80	YOL001W	882 nt		-0.75	□□□□□ -2.53
SKI3	P17883	YHR139C-A	YHR139C-A	312 nt		-0.76	□□□□□ -2.53
SKI3	P17883	YBR184W	YBR184W	1572 nt		-0.77	□□□□□ -2.53
SKI3	P17883	YDR194W-A	YDR194W-A	153 nt		-0.77	□□□□□ -2.53
SKI3	P17883	GEP7	YGL057C	864 nt		-0.77	□□□□□ -2.53
SKI3	P17883	RPL42B	YHR141C	321 nt		-0.77	□□□□□ -2.53
SKI3	P17883	HOT13	YKL084W	351 nt		-0.77	□□□□□ -2.53
SKI3	P17883	RPL42A	YNL162W	321 nt		-0.77	□□□□□ -2.53
SKI3	P17883	YOR169C	YOR169C	465 nt		-0.77	□□□□□ -2.53
SKI3	P17883	ZIP1	YDR285W	2628 nt		-0.77	□□□□□ -2.53
SKI3	P17883	MYO1	YHR023W	5787 nt		-0.78	□□□□□ -2.53
SKI3	P17883	YBR062C	YBR062C	543 nt		-0.78	□□□□□ -2.53
SKI3	P17883	FYV10	YIL097W	1551 nt		-0.79	□□□□□ -2.54
SKI3	P17883	LCD1	YDR499W	2244 nt		-0.79	□□□□□ -2.54
SKI3	P17883	snR8	snR8	190 nt		-0.8	□□□□□ -2.54
SKI3	P17883	YOP1	YPR028W	543 nt		-0.8	□□□□□ -2.54
SKI3	P17883	YEL073C	YEL073C	324 nt		-0.81	□□□□□ -2.54
SKI3	P17883	TIM13	YGR181W	318 nt		-0.81	□□□□□ -2.54
SKI3	P17883	tT(UGU)G1	tT(UGU)G1	72 nt		-0.81	□□□□□ -2.54
SKI3	P17883	tT(UGU)G2	tT(UGU)G2	72 nt		-0.81	□□□□□ -2.54
SKI3	P17883	tT(UGU)P	tT(UGU)P	72 nt		-0.81	□□□□□ -2.54
SKI3	P17883	YLR101C	YLR101C	396 nt		-0.81	□□□□□ -2.54
SKI3	P17883	PTP2	YOR208W	2253 nt		-0.81	□□□□□ -2.54
SKI3	P17883	GOS1	YHL031C	672 nt		-0.82	□□□□□ -2.54
SKI3	P17883	YJR011C	YJR011C	786 nt		-0.82	□□□□□ -2.54
SKI3	P17883	COX8	YLR395C	237 nt		-0.82	□□□□□ -2.54
SKI3	P17883	SPO23	YBR250W	1572 nt		-0.83	□□□□□ -2.54
SKI3	P17883	AI5_ALPHA	Q0070	1893 nt		-0.83	□□□□□ -2.54
SKI3	P17883	BET4	YJL031C	984 nt		-0.85	□□□□□ -2.55
SKI3	P17883	YOR186C-A	YOR186C-A	210 nt		-0.85	□□□□□ -2.55
SKI3	P17883	YGR204C-A	YGR204C-A	114 nt		-0.86	□□□□□ -2.55
SKI3	P17883	YPR172W	YPR172W	603 nt		-0.86	□□□□□ -2.55
SKI3	P17883	RTR2	YDR066C	591 nt		-0.87	□□□□□ -2.55
SKI3	P17883	YIR018C-A	YIR018C-A	138 nt		-0.89	□□□□□ -2.55
SKI3	P17883	ORC3	YLL004W	1851 nt		-0.89	□□□□□ -2.55
SKI3	P17883	SOV1	YMR066W	2697 nt		-0.89	□□□□□ -2.55
SKI3	P17883	YCR038W-A	YCR038W-A	126 nt		-0.89	□□□□□ -2.55
SKI3	P17883	HNT1	YDL125C	477 nt		-0.89	□□□□□ -2.55
SKI3	P17883	COX5B	YIL111W	456 nt		-0.89	□□□□□ -2.55
SKI3	P17883	YNL150W	YNL150W	408 nt		-0.89	□□□□□ -2.55
SKI3	P17883	ATP15	YPL271W	189 nt		-0.89	□□□□□ -2.55
SKI3	P17883	BSC3	YLR465C	309 nt		-0.91	□□□□□ -2.56
SKI3	P17883	DAD1	YDR016C	285 nt		-0.92	□□□□□ -2.56
SKI3	P17883	YHL042W	YHL042W	453 nt		-0.92	□□□□□ -2.56
SKI3	P17883	YHL048C-A	YHL048C-A	135 nt		-0.93	□□□□□ -2.56
SKI3	P17883	RFA3	YJL173C	369 nt		-0.93	□□□□□ -2.56
SKI3	P17883	RRT1	YBL048W	312 nt		-0.93	□□□□□ -2.56
SKI3	P17883	SPO11	YHL022C	1197 nt		-0.94	□□□□□ -2.56
SKI3	P17883	YHR028W-A	YHR028W-A	321 nt		-0.96	□□□□□ -2.56
SKI3	P17883	UPS1	YLR193C	528 nt		-0.96	□□□□□ -2.56
SKI3	P17883	YDR029W	YDR029W	315 nt		-0.97	□□□□□ -2.56
SKI3	P17883	TIM10	YHR005C-A	282 nt		-0.97	□□□□□ -2.56
SKI3	P17883	RPS7B	YNL096C	573 nt		-0.98	□□□□□ -2.57
SKI3	P17883	YDR114C	YDR114C	303 nt		-0.98	□□□□□ -2.57
SKI3	P17883	LSO2	YGR169C-A	279 nt		-0.98	□□□□□ -2.57
SKI3	P17883	YJL156W-A	YJL156W-A	222 nt		-0.98	□□□□□ -2.57
SKI3	P17883	YNL162W-A	YNL162W-A	219 nt		-0.98	□□□□□ -2.57
SKI3	P17883	YCL002C	YCL002C	792 nt		-0.98	□□□□□ -2.57
SKI3	P17883	YOL118C	YOL118C	309 nt		-0.99	□□□□□ -2.57
SKI3	P17883	snR128	snR128	126 nt		-0.99	□□□□□ -2.57
SKI3	P17883	snR161	snR161	161 nt		-0.99	□□□□□ -2.57
SKI3	P17883	YDR371C-A	YDR371C-A	105 nt		-1	□□□□□ -2.57
SKI3	P17883	YKL115C	YKL115C	393 nt		-1	□□□□□ -2.57

Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 29.6 ms