Protein–RNA interactions for Protein: P15170

GSPT1, Eukaryotic peptide chain release factor GTP-binding subunit ERF3A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSPT1P15170 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GSPT1P15170 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GSPT1P15170 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GSPT1P15170 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GSPT1P15170 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GSPT1P15170 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GSPT1P15170 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GSPT1P15170 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GSPT1P15170 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GSPT1P15170 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GSPT1P15170 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GSPT1P15170 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GSPT1P15170 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GSPT1P15170 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GSPT1P15170 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GSPT1P15170 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
GSPT1P15170 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GSPT1P15170 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GSPT1P15170 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GSPT1P15170 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GSPT1P15170 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GSPT1P15170 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GSPT1P15170 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GSPT1P15170 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GSPT1P15170 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GSPT1P15170 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GSPT1P15170 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GSPT1P15170 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GSPT1P15170 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GSPT1P15170 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GSPT1P15170 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GSPT1P15170 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GSPT1P15170 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GSPT1P15170 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GSPT1P15170 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GSPT1P15170 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GSPT1P15170 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GSPT1P15170 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GSPT1P15170 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GSPT1P15170 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GSPT1P15170 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GSPT1P15170 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GSPT1P15170 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GSPT1P15170 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GSPT1P15170 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GSPT1P15170 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GSPT1P15170 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GSPT1P15170 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GSPT1P15170 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GSPT1P15170 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GSPT1P15170 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GSPT1P15170 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GSPT1P15170 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GSPT1P15170 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
GSPT1P15170 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GSPT1P15170 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
GSPT1P15170 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GSPT1P15170 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GSPT1P15170 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GSPT1P15170 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GSPT1P15170 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GSPT1P15170 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
GSPT1P15170 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
GSPT1P15170 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GSPT1P15170 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GSPT1P15170 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GSPT1P15170 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GSPT1P15170 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GSPT1P15170 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GSPT1P15170 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GSPT1P15170 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GSPT1P15170 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
GSPT1P15170 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
GSPT1P15170 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GSPT1P15170 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
GSPT1P15170 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GSPT1P15170 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GSPT1P15170 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GSPT1P15170 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GSPT1P15170 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GSPT1P15170 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
GSPT1P15170 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GSPT1P15170 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GSPT1P15170 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GSPT1P15170 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GSPT1P15170 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GSPT1P15170 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
GSPT1P15170 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GSPT1P15170 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
GSPT1P15170 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
GSPT1P15170 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GSPT1P15170 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GSPT1P15170 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GSPT1P15170 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GSPT1P15170 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GSPT1P15170 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GSPT1P15170 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GSPT1P15170 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GSPT1P15170 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GSPT1P15170 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms