Protein–RNA interactions for Protein: P13994

CCDC130, Coiled-coil domain-containing protein 130, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC130P13994 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC130P13994 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC130P13994 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC130P13994 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC130P13994 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC130P13994 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC130P13994 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC130P13994 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC130P13994 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC130P13994 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC130P13994 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC130P13994 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC130P13994 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC130P13994 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC130P13994 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC130P13994 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC130P13994 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC130P13994 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC130P13994 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC130P13994 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC130P13994 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC130P13994 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC130P13994 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC130P13994 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC130P13994 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC130P13994 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC130P13994 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC130P13994 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC130P13994 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC130P13994 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC130P13994 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC130P13994 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC130P13994 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC130P13994 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC130P13994 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC130P13994 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC130P13994 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC130P13994 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC130P13994 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC130P13994 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC130P13994 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC130P13994 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC130P13994 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC130P13994 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC130P13994 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC130P13994 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC130P13994 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC130P13994 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC130P13994 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC130P13994 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC130P13994 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC130P13994 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC130P13994 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC130P13994 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC130P13994 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC130P13994 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC130P13994 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC130P13994 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC130P13994 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC130P13994 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC130P13994 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC130P13994 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC130P13994 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC130P13994 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC130P13994 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC130P13994 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC130P13994 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC130P13994 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC130P13994 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC130P13994 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC130P13994 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC130P13994 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC130P13994 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC130P13994 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC130P13994 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC130P13994 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC130P13994 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC130P13994 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC130P13994 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC130P13994 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC130P13994 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC130P13994 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC130P13994 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC130P13994 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC130P13994 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC130P13994 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC130P13994 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC130P13994 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC130P13994 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC130P13994 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC130P13994 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC130P13994 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC130P13994 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC130P13994 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC130P13994 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC130P13994 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC130P13994 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC130P13994 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC130P13994 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC130P13994 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms