Protein–RNA interactions for Protein: P01599

IGKV1-17, Immunoglobulin kappa variable 1-17, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGKV1-17P01599 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
IGKV1-17P01599 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
IGKV1-17P01599 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
IGKV1-17P01599 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
IGKV1-17P01599 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
IGKV1-17P01599 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
IGKV1-17P01599 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
IGKV1-17P01599 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
IGKV1-17P01599 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
IGKV1-17P01599 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
IGKV1-17P01599 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
IGKV1-17P01599 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
IGKV1-17P01599 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.1
IGKV1-17P01599 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
IGKV1-17P01599 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IGKV1-17P01599 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IGKV1-17P01599 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
IGKV1-17P01599 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
IGKV1-17P01599 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
IGKV1-17P01599 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
IGKV1-17P01599 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IGKV1-17P01599 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IGKV1-17P01599 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IGKV1-17P01599 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
IGKV1-17P01599 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IGKV1-17P01599 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
IGKV1-17P01599 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IGKV1-17P01599 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
IGKV1-17P01599 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IGKV1-17P01599 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IGKV1-17P01599 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
IGKV1-17P01599 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
IGKV1-17P01599 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
IGKV1-17P01599 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
IGKV1-17P01599 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IGKV1-17P01599 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IGKV1-17P01599 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IGKV1-17P01599 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
IGKV1-17P01599 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
IGKV1-17P01599 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IGKV1-17P01599 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IGKV1-17P01599 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IGKV1-17P01599 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IGKV1-17P01599 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IGKV1-17P01599 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IGKV1-17P01599 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IGKV1-17P01599 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IGKV1-17P01599 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IGKV1-17P01599 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IGKV1-17P01599 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IGKV1-17P01599 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IGKV1-17P01599 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IGKV1-17P01599 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IGKV1-17P01599 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IGKV1-17P01599 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
IGKV1-17P01599 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
IGKV1-17P01599 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IGKV1-17P01599 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IGKV1-17P01599 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
IGKV1-17P01599 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IGKV1-17P01599 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IGKV1-17P01599 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IGKV1-17P01599 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IGKV1-17P01599 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IGKV1-17P01599 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
IGKV1-17P01599 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IGKV1-17P01599 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IGKV1-17P01599 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IGKV1-17P01599 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IGKV1-17P01599 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
IGKV1-17P01599 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IGKV1-17P01599 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IGKV1-17P01599 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IGKV1-17P01599 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IGKV1-17P01599 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IGKV1-17P01599 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IGKV1-17P01599 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IGKV1-17P01599 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IGKV1-17P01599 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IGKV1-17P01599 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IGKV1-17P01599 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IGKV1-17P01599 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IGKV1-17P01599 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IGKV1-17P01599 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IGKV1-17P01599 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IGKV1-17P01599 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IGKV1-17P01599 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IGKV1-17P01599 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IGKV1-17P01599 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IGKV1-17P01599 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IGKV1-17P01599 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IGKV1-17P01599 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IGKV1-17P01599 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IGKV1-17P01599 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IGKV1-17P01599 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IGKV1-17P01599 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IGKV1-17P01599 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IGKV1-17P01599 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IGKV1-17P01599 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IGKV1-17P01599 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms