Protein–RNA interactions for Protein: O94955

RHOBTB3, Rho-related BTB domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOBTB3O94955 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RHOBTB3O94955 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RHOBTB3O94955 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RHOBTB3O94955 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RHOBTB3O94955 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RHOBTB3O94955 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RHOBTB3O94955 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RHOBTB3O94955 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RHOBTB3O94955 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RHOBTB3O94955 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RHOBTB3O94955 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RHOBTB3O94955 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RHOBTB3O94955 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RHOBTB3O94955 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RHOBTB3O94955 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RHOBTB3O94955 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RHOBTB3O94955 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RHOBTB3O94955 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
RHOBTB3O94955 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RHOBTB3O94955 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RHOBTB3O94955 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RHOBTB3O94955 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RHOBTB3O94955 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RHOBTB3O94955 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RHOBTB3O94955 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
RHOBTB3O94955 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RHOBTB3O94955 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RHOBTB3O94955 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RHOBTB3O94955 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RHOBTB3O94955 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RHOBTB3O94955 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RHOBTB3O94955 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RHOBTB3O94955 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RHOBTB3O94955 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RHOBTB3O94955 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RHOBTB3O94955 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RHOBTB3O94955 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RHOBTB3O94955 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RHOBTB3O94955 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RHOBTB3O94955 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RHOBTB3O94955 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RHOBTB3O94955 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RHOBTB3O94955 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RHOBTB3O94955 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RHOBTB3O94955 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RHOBTB3O94955 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RHOBTB3O94955 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RHOBTB3O94955 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RHOBTB3O94955 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RHOBTB3O94955 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RHOBTB3O94955 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RHOBTB3O94955 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RHOBTB3O94955 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RHOBTB3O94955 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RHOBTB3O94955 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RHOBTB3O94955 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RHOBTB3O94955 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RHOBTB3O94955 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RHOBTB3O94955 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RHOBTB3O94955 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RHOBTB3O94955 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RHOBTB3O94955 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RHOBTB3O94955 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RHOBTB3O94955 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RHOBTB3O94955 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RHOBTB3O94955 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RHOBTB3O94955 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
RHOBTB3O94955 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RHOBTB3O94955 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RHOBTB3O94955 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RHOBTB3O94955 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RHOBTB3O94955 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
RHOBTB3O94955 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RHOBTB3O94955 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RHOBTB3O94955 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
RHOBTB3O94955 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RHOBTB3O94955 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RHOBTB3O94955 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RHOBTB3O94955 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RHOBTB3O94955 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
RHOBTB3O94955 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RHOBTB3O94955 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RHOBTB3O94955 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RHOBTB3O94955 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
RHOBTB3O94955 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
RHOBTB3O94955 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RHOBTB3O94955 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RHOBTB3O94955 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RHOBTB3O94955 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RHOBTB3O94955 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RHOBTB3O94955 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RHOBTB3O94955 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RHOBTB3O94955 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RHOBTB3O94955 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RHOBTB3O94955 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RHOBTB3O94955 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RHOBTB3O94955 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RHOBTB3O94955 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RHOBTB3O94955 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RHOBTB3O94955 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms