Protein–RNA interactions for Protein: O76039

CDKL5, Cyclin-dependent kinase-like 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,030 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL5O76039 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDKL5O76039 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CDKL5O76039 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDKL5O76039 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CDKL5O76039 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDKL5O76039 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDKL5O76039 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDKL5O76039 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDKL5O76039 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDKL5O76039 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDKL5O76039 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDKL5O76039 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDKL5O76039 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDKL5O76039 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDKL5O76039 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDKL5O76039 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDKL5O76039 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDKL5O76039 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDKL5O76039 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDKL5O76039 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDKL5O76039 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDKL5O76039 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDKL5O76039 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDKL5O76039 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDKL5O76039 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDKL5O76039 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDKL5O76039 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDKL5O76039 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDKL5O76039 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDKL5O76039 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDKL5O76039 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDKL5O76039 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CDKL5O76039 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CDKL5O76039 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CDKL5O76039 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDKL5O76039 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDKL5O76039 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDKL5O76039 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDKL5O76039 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDKL5O76039 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDKL5O76039 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDKL5O76039 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDKL5O76039 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDKL5O76039 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CDKL5O76039 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDKL5O76039 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDKL5O76039 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CDKL5O76039 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDKL5O76039 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDKL5O76039 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDKL5O76039 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDKL5O76039 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDKL5O76039 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDKL5O76039 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CDKL5O76039 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDKL5O76039 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDKL5O76039 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDKL5O76039 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDKL5O76039 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDKL5O76039 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDKL5O76039 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDKL5O76039 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDKL5O76039 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDKL5O76039 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDKL5O76039 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CDKL5O76039 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CDKL5O76039 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDKL5O76039 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDKL5O76039 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDKL5O76039 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CDKL5O76039 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDKL5O76039 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDKL5O76039 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CDKL5O76039 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDKL5O76039 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDKL5O76039 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDKL5O76039 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDKL5O76039 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDKL5O76039 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDKL5O76039 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDKL5O76039 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDKL5O76039 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDKL5O76039 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDKL5O76039 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDKL5O76039 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CDKL5O76039 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDKL5O76039 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDKL5O76039 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDKL5O76039 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDKL5O76039 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CDKL5O76039 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDKL5O76039 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CDKL5O76039 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDKL5O76039 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDKL5O76039 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDKL5O76039 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CDKL5O76039 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDKL5O76039 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDKL5O76039 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CDKL5O76039 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms