Protein–RNA interactions for Protein: H0YCG3

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H0YCG3 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
H0YCG3 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
H0YCG3 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
H0YCG3 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
H0YCG3 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
H0YCG3 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
H0YCG3 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
H0YCG3 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
H0YCG3 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
H0YCG3 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
H0YCG3 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
H0YCG3 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
H0YCG3 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
H0YCG3 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
H0YCG3 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
H0YCG3 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
H0YCG3 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
H0YCG3 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
H0YCG3 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
H0YCG3 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
H0YCG3 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
H0YCG3 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
H0YCG3 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
H0YCG3 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
H0YCG3 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
H0YCG3 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
H0YCG3 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
H0YCG3 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
H0YCG3 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
H0YCG3 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
H0YCG3 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
H0YCG3 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
H0YCG3 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
H0YCG3 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
H0YCG3 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
H0YCG3 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
H0YCG3 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
H0YCG3 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
H0YCG3 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
H0YCG3 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
H0YCG3 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
H0YCG3 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
H0YCG3 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
H0YCG3 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
H0YCG3 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
H0YCG3 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
H0YCG3 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
H0YCG3 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
H0YCG3 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
H0YCG3 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
H0YCG3 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
H0YCG3 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
H0YCG3 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
H0YCG3 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
H0YCG3 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
H0YCG3 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
H0YCG3 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
H0YCG3 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
H0YCG3 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
H0YCG3 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
H0YCG3 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
H0YCG3 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
H0YCG3 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
H0YCG3 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
H0YCG3 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
H0YCG3 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
H0YCG3 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
H0YCG3 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
H0YCG3 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
H0YCG3 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
H0YCG3 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
H0YCG3 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
H0YCG3 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
H0YCG3 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
H0YCG3 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
H0YCG3 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
H0YCG3 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
H0YCG3 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
H0YCG3 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
H0YCG3 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
H0YCG3 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
H0YCG3 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
H0YCG3 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
H0YCG3 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
H0YCG3 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
H0YCG3 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
H0YCG3 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
H0YCG3 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
H0YCG3 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
H0YCG3 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
H0YCG3 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
H0YCG3 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
H0YCG3 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
H0YCG3 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
H0YCG3 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
H0YCG3 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
H0YCG3 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
H0YCG3 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
H0YCG3 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
H0YCG3 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms