Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 AC010745.4-201ENST00000420130 740 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 AC096711.3-201ENST00000420721 582 ntTSL 4 BASIC7.22□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 AC090044.1-201ENST00000423193 497 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 RPSAP10-201ENST00000426103 878 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 PAICSP5-201ENST00000430406 1217 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 FECHP1-201ENST00000431896 1214 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 PIGCP2-201ENST00000433617 835 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 AC004006.1-201ENST00000434994 377 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 AC024082.1-201ENST00000435250 699 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 AL731567.1-201ENST00000435635 462 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 AL355149.1-201ENST00000438396 882 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 PRSS37-203ENST00000438520 826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 AC008175.1-202ENST00000439653 745 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 AC022400.2-201ENST00000446730 866 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 OSBPL10-AS1-207ENST00000455961 411 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 AC004448.4-203ENST00000456537 441 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 AC087501.2-201ENST00000466869 581 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 TUBB3P2-201ENST00000480063 232 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 RPL5P29-201ENST00000482972 894 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 LINC02160-201ENST00000503577 517 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 ZBED3-AS1-209ENST00000512213 681 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 SNHG27-203ENST00000514222 680 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 RNU6-491P-201ENST00000516099 110 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 IGHVII-26-2-201ENST00000518751 325 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 BRIX1P1-201ENST00000521785 908 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 AP003086.2-201ENST00000534168 437 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 LINC01965-202ENST00000537492 552 ntTSL 4 BASIC7.22□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 FLVCR2-202ENST00000539311 1221 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 AP002892.2-201ENST00000544195 560 ntTSL 4 BASIC7.22□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 PRR13-207ENST00000549581 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 COX5AP2-201ENST00000554418 394 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 LINC02207-201ENST00000554530 1256 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 LINC02325-203ENST00000554862 733 ntTSL 4 BASIC7.22□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 CKS1BP1-201ENST00000555221 240 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 SUPT16H-204ENST00000555943 915 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 LINC02137-201ENST00000561906 644 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 ARPP19-209ENST00000567669 745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 SNURF-202ENST00000577949 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 RN7SL118P-201ENST00000580570 302 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 AC104984.6-201ENST00000591928 360 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 INTS6-AS1-204ENST00000593709 648 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 PRYP3-202ENST00000607210 444 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 AL121583.1-201ENST00000612444 682 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 uc_338.2-201ENST00000612963 182 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 Metazoa_SRP.120-201ENST00000614195 252 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 AC009053.4-201ENST00000614366 108 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 AC005691.1-201ENST00000624723 401 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 MMACHC-201ENST00000401061 5296 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 ZNF320-201ENST00000391781 6074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 FAM135B-204ENST00000395297 6962 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 ZSCAN5B-201ENST00000358992 1626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 MET-204ENST00000436117 2295 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 DDX24-205ENST00000555054 2769 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 AC022486.1-201ENST00000510613 1483 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 TNFRSF19-204ENST00000403372 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 Z97832.2-201ENST00000605896 4261 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 ASB15-205ENST00000451215 2956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 SCG3-201ENST00000220478 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 HCP5-201ENST00000414046 2658 ntTSL 4 BASIC7.22□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 HELB-201ENST00000247815 12866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 PPARGC1B-201ENST00000309241 10568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 AL049833.3-201ENST00000623920 3738 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 RTL9-201ENST00000465301 5426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 DCLRE1C-209ENST00000378278 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 PIWIL3-204ENST00000533313 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 HEATR6-201ENST00000184956 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 NAV2-216ENST00000540292 11003 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 C8orf37-201ENST00000286688 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 DDX21-201ENST00000354185 4711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 AC010533.1-201ENST00000624875 2105 ntBASIC7.21□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 CTNND1-234ENST00000532844 6012 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
PDCD1Q15116 THAP12P6-201ENST00000431978 2310 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 AC110792.3-201ENST00000595906 1614 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 CASC19-261ENST00000641853 1638 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 KLF7-202ENST00000412414 7954 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 ZNF726-202ENST00000334589 847 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 RN7SKP75-201ENST00000363070 296 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 LINC01620-202ENST00000372910 649 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 SERPINB8-204ENST00000397988 1178 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 RN7SKP139-201ENST00000410411 293 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 AL513302.1-201ENST00000415679 428 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 LINC00630-202ENST00000420471 838 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 VNN3-208ENST00000427187 1214 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 ISX-AS1-201ENST00000427881 202 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 RPL12P14-201ENST00000431782 490 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 C2orf74-203ENST00000432605 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 FABP5P10-201ENST00000435729 408 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 AL356498.1-201ENST00000443334 334 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 AC119428.2-201ENST00000449958 850 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 AL356310.1-201ENST00000452024 585 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 LINC01647-201ENST00000453135 1285 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 AC025465.1-201ENST00000503145 797 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 HAUS1P1-201ENST00000505275 832 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 SEC11B-201ENST00000518383 499 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 AC018607.1-201ENST00000518552 673 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 VTA1P2-201ENST00000520205 911 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 IGLV3-7-201ENST00000522952 271 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 HNRNPA1P38-201ENST00000523612 957 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 AC021820.1-201ENST00000525564 808 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
PDCD1Q15116 SOX9-AS1-211ENST00000533179 460 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118.6 ms