Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y561

LRP12, Low-density lipoprotein receptor-related protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 859 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP12Q9Y561 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LRP12Q9Y561 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LRP12Q9Y561 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LRP12Q9Y561 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LRP12Q9Y561 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LRP12Q9Y561 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LRP12Q9Y561 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LRP12Q9Y561 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LRP12Q9Y561 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LRP12Q9Y561 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LRP12Q9Y561 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LRP12Q9Y561 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LRP12Q9Y561 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LRP12Q9Y561 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LRP12Q9Y561 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LRP12Q9Y561 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LRP12Q9Y561 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LRP12Q9Y561 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LRP12Q9Y561 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LRP12Q9Y561 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LRP12Q9Y561 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LRP12Q9Y561 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LRP12Q9Y561 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LRP12Q9Y561 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LRP12Q9Y561 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LRP12Q9Y561 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LRP12Q9Y561 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LRP12Q9Y561 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LRP12Q9Y561 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LRP12Q9Y561 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LRP12Q9Y561 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LRP12Q9Y561 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LRP12Q9Y561 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LRP12Q9Y561 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LRP12Q9Y561 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LRP12Q9Y561 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LRP12Q9Y561 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LRP12Q9Y561 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LRP12Q9Y561 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LRP12Q9Y561 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LRP12Q9Y561 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LRP12Q9Y561 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LRP12Q9Y561 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LRP12Q9Y561 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
LRP12Q9Y561 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LRP12Q9Y561 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LRP12Q9Y561 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LRP12Q9Y561 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LRP12Q9Y561 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LRP12Q9Y561 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LRP12Q9Y561 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LRP12Q9Y561 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LRP12Q9Y561 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LRP12Q9Y561 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LRP12Q9Y561 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LRP12Q9Y561 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LRP12Q9Y561 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LRP12Q9Y561 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LRP12Q9Y561 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LRP12Q9Y561 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LRP12Q9Y561 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LRP12Q9Y561 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LRP12Q9Y561 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LRP12Q9Y561 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LRP12Q9Y561 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LRP12Q9Y561 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LRP12Q9Y561 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LRP12Q9Y561 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LRP12Q9Y561 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LRP12Q9Y561 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LRP12Q9Y561 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LRP12Q9Y561 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LRP12Q9Y561 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LRP12Q9Y561 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LRP12Q9Y561 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LRP12Q9Y561 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LRP12Q9Y561 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LRP12Q9Y561 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LRP12Q9Y561 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LRP12Q9Y561 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LRP12Q9Y561 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LRP12Q9Y561 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
LRP12Q9Y561 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LRP12Q9Y561 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LRP12Q9Y561 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LRP12Q9Y561 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LRP12Q9Y561 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LRP12Q9Y561 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LRP12Q9Y561 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LRP12Q9Y561 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LRP12Q9Y561 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LRP12Q9Y561 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LRP12Q9Y561 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LRP12Q9Y561 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LRP12Q9Y561 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
LRP12Q9Y561 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
LRP12Q9Y561 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
LRP12Q9Y561 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
LRP12Q9Y561 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
LRP12Q9Y561 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms