Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y448

KNSTRN, Small kinetochore-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNSTRNQ9Y448 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
KNSTRNQ9Y448 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
KNSTRNQ9Y448 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
KNSTRNQ9Y448 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
KNSTRNQ9Y448 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
KNSTRNQ9Y448 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
KNSTRNQ9Y448 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
KNSTRNQ9Y448 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
KNSTRNQ9Y448 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
KNSTRNQ9Y448 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
KNSTRNQ9Y448 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
KNSTRNQ9Y448 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
KNSTRNQ9Y448 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
KNSTRNQ9Y448 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
KNSTRNQ9Y448 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
KNSTRNQ9Y448 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
KNSTRNQ9Y448 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
KNSTRNQ9Y448 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
KNSTRNQ9Y448 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
KNSTRNQ9Y448 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
KNSTRNQ9Y448 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
KNSTRNQ9Y448 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
KNSTRNQ9Y448 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
KNSTRNQ9Y448 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
KNSTRNQ9Y448 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
KNSTRNQ9Y448 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
KNSTRNQ9Y448 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
KNSTRNQ9Y448 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.59■■■□□ 2.01
KNSTRNQ9Y448 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
KNSTRNQ9Y448 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
KNSTRNQ9Y448 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
KNSTRNQ9Y448 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
KNSTRNQ9Y448 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
KNSTRNQ9Y448 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
KNSTRNQ9Y448 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
KNSTRNQ9Y448 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
KNSTRNQ9Y448 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
KNSTRNQ9Y448 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
KNSTRNQ9Y448 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
KNSTRNQ9Y448 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
KNSTRNQ9Y448 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
KNSTRNQ9Y448 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
KNSTRNQ9Y448 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
KNSTRNQ9Y448 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
KNSTRNQ9Y448 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
KNSTRNQ9Y448 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
KNSTRNQ9Y448 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
KNSTRNQ9Y448 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
KNSTRNQ9Y448 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
KNSTRNQ9Y448 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2
KNSTRNQ9Y448 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
KNSTRNQ9Y448 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
KNSTRNQ9Y448 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
KNSTRNQ9Y448 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
KNSTRNQ9Y448 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
KNSTRNQ9Y448 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
KNSTRNQ9Y448 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
KNSTRNQ9Y448 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
KNSTRNQ9Y448 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
KNSTRNQ9Y448 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC27.57■■■□□ 2
KNSTRNQ9Y448 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
KNSTRNQ9Y448 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC27.57■■■□□ 2
KNSTRNQ9Y448 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
KNSTRNQ9Y448 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
KNSTRNQ9Y448 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
KNSTRNQ9Y448 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
KNSTRNQ9Y448 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC27.57■■■□□ 2
KNSTRNQ9Y448 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
KNSTRNQ9Y448 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
KNSTRNQ9Y448 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
KNSTRNQ9Y448 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
KNSTRNQ9Y448 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
KNSTRNQ9Y448 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
KNSTRNQ9Y448 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
KNSTRNQ9Y448 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
KNSTRNQ9Y448 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
KNSTRNQ9Y448 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
KNSTRNQ9Y448 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
KNSTRNQ9Y448 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
KNSTRNQ9Y448 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
KNSTRNQ9Y448 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
KNSTRNQ9Y448 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
KNSTRNQ9Y448 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
KNSTRNQ9Y448 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
KNSTRNQ9Y448 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
KNSTRNQ9Y448 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
KNSTRNQ9Y448 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
KNSTRNQ9Y448 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
KNSTRNQ9Y448 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
KNSTRNQ9Y448 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
KNSTRNQ9Y448 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
KNSTRNQ9Y448 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
KNSTRNQ9Y448 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
KNSTRNQ9Y448 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
KNSTRNQ9Y448 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
KNSTRNQ9Y448 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
KNSTRNQ9Y448 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
KNSTRNQ9Y448 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
KNSTRNQ9Y448 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
KNSTRNQ9Y448 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms