Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3E1

HDGFL3, Hepatoma-derived growth factor-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFL3Q9Y3E1 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HDGFL3Q9Y3E1 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HDGFL3Q9Y3E1 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
HDGFL3Q9Y3E1 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HDGFL3Q9Y3E1 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HDGFL3Q9Y3E1 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HDGFL3Q9Y3E1 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HDGFL3Q9Y3E1 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HDGFL3Q9Y3E1 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HDGFL3Q9Y3E1 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HDGFL3Q9Y3E1 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HDGFL3Q9Y3E1 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HDGFL3Q9Y3E1 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HDGFL3Q9Y3E1 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HDGFL3Q9Y3E1 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HDGFL3Q9Y3E1 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HDGFL3Q9Y3E1 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HDGFL3Q9Y3E1 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HDGFL3Q9Y3E1 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HDGFL3Q9Y3E1 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HDGFL3Q9Y3E1 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
HDGFL3Q9Y3E1 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HDGFL3Q9Y3E1 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HDGFL3Q9Y3E1 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HDGFL3Q9Y3E1 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HDGFL3Q9Y3E1 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HDGFL3Q9Y3E1 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
HDGFL3Q9Y3E1 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
HDGFL3Q9Y3E1 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HDGFL3Q9Y3E1 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HDGFL3Q9Y3E1 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HDGFL3Q9Y3E1 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HDGFL3Q9Y3E1 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HDGFL3Q9Y3E1 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HDGFL3Q9Y3E1 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HDGFL3Q9Y3E1 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HDGFL3Q9Y3E1 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HDGFL3Q9Y3E1 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HDGFL3Q9Y3E1 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HDGFL3Q9Y3E1 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HDGFL3Q9Y3E1 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HDGFL3Q9Y3E1 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HDGFL3Q9Y3E1 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HDGFL3Q9Y3E1 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HDGFL3Q9Y3E1 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HDGFL3Q9Y3E1 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HDGFL3Q9Y3E1 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HDGFL3Q9Y3E1 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HDGFL3Q9Y3E1 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HDGFL3Q9Y3E1 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HDGFL3Q9Y3E1 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HDGFL3Q9Y3E1 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HDGFL3Q9Y3E1 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
HDGFL3Q9Y3E1 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
HDGFL3Q9Y3E1 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HDGFL3Q9Y3E1 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
HDGFL3Q9Y3E1 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HDGFL3Q9Y3E1 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HDGFL3Q9Y3E1 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HDGFL3Q9Y3E1 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HDGFL3Q9Y3E1 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HDGFL3Q9Y3E1 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
HDGFL3Q9Y3E1 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HDGFL3Q9Y3E1 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
HDGFL3Q9Y3E1 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
HDGFL3Q9Y3E1 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
HDGFL3Q9Y3E1 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
HDGFL3Q9Y3E1 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HDGFL3Q9Y3E1 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HDGFL3Q9Y3E1 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
HDGFL3Q9Y3E1 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HDGFL3Q9Y3E1 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HDGFL3Q9Y3E1 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HDGFL3Q9Y3E1 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HDGFL3Q9Y3E1 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
HDGFL3Q9Y3E1 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HDGFL3Q9Y3E1 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HDGFL3Q9Y3E1 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
HDGFL3Q9Y3E1 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HDGFL3Q9Y3E1 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HDGFL3Q9Y3E1 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
HDGFL3Q9Y3E1 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HDGFL3Q9Y3E1 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HDGFL3Q9Y3E1 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HDGFL3Q9Y3E1 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HDGFL3Q9Y3E1 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HDGFL3Q9Y3E1 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HDGFL3Q9Y3E1 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HDGFL3Q9Y3E1 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HDGFL3Q9Y3E1 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HDGFL3Q9Y3E1 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HDGFL3Q9Y3E1 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HDGFL3Q9Y3E1 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HDGFL3Q9Y3E1 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HDGFL3Q9Y3E1 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HDGFL3Q9Y3E1 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HDGFL3Q9Y3E1 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HDGFL3Q9Y3E1 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HDGFL3Q9Y3E1 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HDGFL3Q9Y3E1 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms