Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2E6

DTX4, E3 ubiquitin-protein ligase DTX4, humanhuman

Predictions only

Length 619 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTX4Q9Y2E6 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
DTX4Q9Y2E6 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
DTX4Q9Y2E6 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
DTX4Q9Y2E6 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
DTX4Q9Y2E6 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
DTX4Q9Y2E6 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
DTX4Q9Y2E6 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DTX4Q9Y2E6 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DTX4Q9Y2E6 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DTX4Q9Y2E6 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DTX4Q9Y2E6 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DTX4Q9Y2E6 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
DTX4Q9Y2E6 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
DTX4Q9Y2E6 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
DTX4Q9Y2E6 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
DTX4Q9Y2E6 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
DTX4Q9Y2E6 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
DTX4Q9Y2E6 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DTX4Q9Y2E6 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DTX4Q9Y2E6 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DTX4Q9Y2E6 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DTX4Q9Y2E6 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DTX4Q9Y2E6 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DTX4Q9Y2E6 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DTX4Q9Y2E6 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
DTX4Q9Y2E6 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
DTX4Q9Y2E6 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DTX4Q9Y2E6 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DTX4Q9Y2E6 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
DTX4Q9Y2E6 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
DTX4Q9Y2E6 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DTX4Q9Y2E6 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DTX4Q9Y2E6 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DTX4Q9Y2E6 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DTX4Q9Y2E6 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DTX4Q9Y2E6 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DTX4Q9Y2E6 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
DTX4Q9Y2E6 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
DTX4Q9Y2E6 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
DTX4Q9Y2E6 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
DTX4Q9Y2E6 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
DTX4Q9Y2E6 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DTX4Q9Y2E6 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DTX4Q9Y2E6 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DTX4Q9Y2E6 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
DTX4Q9Y2E6 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DTX4Q9Y2E6 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
DTX4Q9Y2E6 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
DTX4Q9Y2E6 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
DTX4Q9Y2E6 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
DTX4Q9Y2E6 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
DTX4Q9Y2E6 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DTX4Q9Y2E6 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DTX4Q9Y2E6 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DTX4Q9Y2E6 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DTX4Q9Y2E6 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
DTX4Q9Y2E6 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DTX4Q9Y2E6 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
DTX4Q9Y2E6 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DTX4Q9Y2E6 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DTX4Q9Y2E6 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DTX4Q9Y2E6 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DTX4Q9Y2E6 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DTX4Q9Y2E6 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DTX4Q9Y2E6 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DTX4Q9Y2E6 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
DTX4Q9Y2E6 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DTX4Q9Y2E6 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DTX4Q9Y2E6 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DTX4Q9Y2E6 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DTX4Q9Y2E6 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DTX4Q9Y2E6 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DTX4Q9Y2E6 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DTX4Q9Y2E6 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DTX4Q9Y2E6 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
DTX4Q9Y2E6 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DTX4Q9Y2E6 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DTX4Q9Y2E6 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DTX4Q9Y2E6 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DTX4Q9Y2E6 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
DTX4Q9Y2E6 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DTX4Q9Y2E6 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DTX4Q9Y2E6 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DTX4Q9Y2E6 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DTX4Q9Y2E6 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DTX4Q9Y2E6 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DTX4Q9Y2E6 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DTX4Q9Y2E6 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
DTX4Q9Y2E6 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DTX4Q9Y2E6 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DTX4Q9Y2E6 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DTX4Q9Y2E6 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DTX4Q9Y2E6 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DTX4Q9Y2E6 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DTX4Q9Y2E6 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DTX4Q9Y2E6 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DTX4Q9Y2E6 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DTX4Q9Y2E6 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DTX4Q9Y2E6 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DTX4Q9Y2E6 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms