Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ4

TRIM35, Tripartite motif-containing protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM35Q9UPQ4 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRIM35Q9UPQ4 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TRIM35Q9UPQ4 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TRIM35Q9UPQ4 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TRIM35Q9UPQ4 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TRIM35Q9UPQ4 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TRIM35Q9UPQ4 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TRIM35Q9UPQ4 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TRIM35Q9UPQ4 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
TRIM35Q9UPQ4 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TRIM35Q9UPQ4 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TRIM35Q9UPQ4 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TRIM35Q9UPQ4 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TRIM35Q9UPQ4 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TRIM35Q9UPQ4 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TRIM35Q9UPQ4 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
TRIM35Q9UPQ4 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TRIM35Q9UPQ4 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TRIM35Q9UPQ4 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TRIM35Q9UPQ4 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
TRIM35Q9UPQ4 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
TRIM35Q9UPQ4 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TRIM35Q9UPQ4 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TRIM35Q9UPQ4 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TRIM35Q9UPQ4 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TRIM35Q9UPQ4 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TRIM35Q9UPQ4 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TRIM35Q9UPQ4 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TRIM35Q9UPQ4 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TRIM35Q9UPQ4 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TRIM35Q9UPQ4 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TRIM35Q9UPQ4 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TRIM35Q9UPQ4 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TRIM35Q9UPQ4 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TRIM35Q9UPQ4 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TRIM35Q9UPQ4 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TRIM35Q9UPQ4 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TRIM35Q9UPQ4 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TRIM35Q9UPQ4 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TRIM35Q9UPQ4 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TRIM35Q9UPQ4 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TRIM35Q9UPQ4 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TRIM35Q9UPQ4 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
TRIM35Q9UPQ4 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TRIM35Q9UPQ4 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
TRIM35Q9UPQ4 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TRIM35Q9UPQ4 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TRIM35Q9UPQ4 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TRIM35Q9UPQ4 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TRIM35Q9UPQ4 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TRIM35Q9UPQ4 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TRIM35Q9UPQ4 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TRIM35Q9UPQ4 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TRIM35Q9UPQ4 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TRIM35Q9UPQ4 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
TRIM35Q9UPQ4 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TRIM35Q9UPQ4 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TRIM35Q9UPQ4 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TRIM35Q9UPQ4 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TRIM35Q9UPQ4 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TRIM35Q9UPQ4 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TRIM35Q9UPQ4 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TRIM35Q9UPQ4 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TRIM35Q9UPQ4 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TRIM35Q9UPQ4 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TRIM35Q9UPQ4 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
TRIM35Q9UPQ4 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TRIM35Q9UPQ4 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TRIM35Q9UPQ4 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TRIM35Q9UPQ4 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TRIM35Q9UPQ4 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TRIM35Q9UPQ4 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TRIM35Q9UPQ4 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TRIM35Q9UPQ4 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TRIM35Q9UPQ4 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TRIM35Q9UPQ4 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TRIM35Q9UPQ4 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TRIM35Q9UPQ4 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TRIM35Q9UPQ4 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TRIM35Q9UPQ4 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TRIM35Q9UPQ4 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TRIM35Q9UPQ4 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TRIM35Q9UPQ4 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TRIM35Q9UPQ4 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
TRIM35Q9UPQ4 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TRIM35Q9UPQ4 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TRIM35Q9UPQ4 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TRIM35Q9UPQ4 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TRIM35Q9UPQ4 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TRIM35Q9UPQ4 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TRIM35Q9UPQ4 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TRIM35Q9UPQ4 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TRIM35Q9UPQ4 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TRIM35Q9UPQ4 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TRIM35Q9UPQ4 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TRIM35Q9UPQ4 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TRIM35Q9UPQ4 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TRIM35Q9UPQ4 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TRIM35Q9UPQ4 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
TRIM35Q9UPQ4 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms