Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULK4

MED23, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 23, humanhuman

Predictions only

Length 1,368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED23Q9ULK4 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
MED23Q9ULK4 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
MED23Q9ULK4 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
MED23Q9ULK4 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
MED23Q9ULK4 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MED23Q9ULK4 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
MED23Q9ULK4 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
MED23Q9ULK4 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MED23Q9ULK4 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MED23Q9ULK4 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MED23Q9ULK4 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MED23Q9ULK4 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
MED23Q9ULK4 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MED23Q9ULK4 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
MED23Q9ULK4 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MED23Q9ULK4 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MED23Q9ULK4 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MED23Q9ULK4 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MED23Q9ULK4 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MED23Q9ULK4 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MED23Q9ULK4 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MED23Q9ULK4 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MED23Q9ULK4 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MED23Q9ULK4 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MED23Q9ULK4 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MED23Q9ULK4 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MED23Q9ULK4 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MED23Q9ULK4 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MED23Q9ULK4 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MED23Q9ULK4 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
MED23Q9ULK4 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MED23Q9ULK4 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MED23Q9ULK4 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MED23Q9ULK4 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MED23Q9ULK4 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MED23Q9ULK4 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MED23Q9ULK4 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MED23Q9ULK4 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MED23Q9ULK4 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MED23Q9ULK4 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MED23Q9ULK4 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MED23Q9ULK4 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
MED23Q9ULK4 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MED23Q9ULK4 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MED23Q9ULK4 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MED23Q9ULK4 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MED23Q9ULK4 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MED23Q9ULK4 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
MED23Q9ULK4 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MED23Q9ULK4 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MED23Q9ULK4 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MED23Q9ULK4 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MED23Q9ULK4 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MED23Q9ULK4 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MED23Q9ULK4 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MED23Q9ULK4 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MED23Q9ULK4 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MED23Q9ULK4 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MED23Q9ULK4 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MED23Q9ULK4 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MED23Q9ULK4 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MED23Q9ULK4 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
MED23Q9ULK4 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
MED23Q9ULK4 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MED23Q9ULK4 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MED23Q9ULK4 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MED23Q9ULK4 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MED23Q9ULK4 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MED23Q9ULK4 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MED23Q9ULK4 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MED23Q9ULK4 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MED23Q9ULK4 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MED23Q9ULK4 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MED23Q9ULK4 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MED23Q9ULK4 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MED23Q9ULK4 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MED23Q9ULK4 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MED23Q9ULK4 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MED23Q9ULK4 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MED23Q9ULK4 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MED23Q9ULK4 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MED23Q9ULK4 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MED23Q9ULK4 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MED23Q9ULK4 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MED23Q9ULK4 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MED23Q9ULK4 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MED23Q9ULK4 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MED23Q9ULK4 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MED23Q9ULK4 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MED23Q9ULK4 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MED23Q9ULK4 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MED23Q9ULK4 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MED23Q9ULK4 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MED23Q9ULK4 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
MED23Q9ULK4 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
MED23Q9ULK4 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MED23Q9ULK4 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MED23Q9ULK4 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MED23Q9ULK4 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MED23Q9ULK4 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms