Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXV6

CDKN2AIP, CDKN2A-interacting protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 580 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN2AIPQ9NXV6 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDKN2AIPQ9NXV6 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDKN2AIPQ9NXV6 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CDKN2AIPQ9NXV6 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDKN2AIPQ9NXV6 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDKN2AIPQ9NXV6 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDKN2AIPQ9NXV6 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDKN2AIPQ9NXV6 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDKN2AIPQ9NXV6 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDKN2AIPQ9NXV6 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CDKN2AIPQ9NXV6 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDKN2AIPQ9NXV6 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDKN2AIPQ9NXV6 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDKN2AIPQ9NXV6 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDKN2AIPQ9NXV6 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDKN2AIPQ9NXV6 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CDKN2AIPQ9NXV6 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDKN2AIPQ9NXV6 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDKN2AIPQ9NXV6 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDKN2AIPQ9NXV6 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDKN2AIPQ9NXV6 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDKN2AIPQ9NXV6 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDKN2AIPQ9NXV6 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDKN2AIPQ9NXV6 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDKN2AIPQ9NXV6 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDKN2AIPQ9NXV6 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDKN2AIPQ9NXV6 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDKN2AIPQ9NXV6 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDKN2AIPQ9NXV6 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDKN2AIPQ9NXV6 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDKN2AIPQ9NXV6 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDKN2AIPQ9NXV6 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDKN2AIPQ9NXV6 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDKN2AIPQ9NXV6 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDKN2AIPQ9NXV6 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDKN2AIPQ9NXV6 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDKN2AIPQ9NXV6 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CDKN2AIPQ9NXV6 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDKN2AIPQ9NXV6 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDKN2AIPQ9NXV6 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDKN2AIPQ9NXV6 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDKN2AIPQ9NXV6 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDKN2AIPQ9NXV6 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDKN2AIPQ9NXV6 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDKN2AIPQ9NXV6 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDKN2AIPQ9NXV6 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDKN2AIPQ9NXV6 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDKN2AIPQ9NXV6 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDKN2AIPQ9NXV6 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDKN2AIPQ9NXV6 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDKN2AIPQ9NXV6 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDKN2AIPQ9NXV6 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CDKN2AIPQ9NXV6 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDKN2AIPQ9NXV6 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDKN2AIPQ9NXV6 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDKN2AIPQ9NXV6 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDKN2AIPQ9NXV6 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDKN2AIPQ9NXV6 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDKN2AIPQ9NXV6 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDKN2AIPQ9NXV6 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDKN2AIPQ9NXV6 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDKN2AIPQ9NXV6 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDKN2AIPQ9NXV6 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDKN2AIPQ9NXV6 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDKN2AIPQ9NXV6 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDKN2AIPQ9NXV6 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDKN2AIPQ9NXV6 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDKN2AIPQ9NXV6 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDKN2AIPQ9NXV6 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDKN2AIPQ9NXV6 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDKN2AIPQ9NXV6 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CDKN2AIPQ9NXV6 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CDKN2AIPQ9NXV6 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CDKN2AIPQ9NXV6 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDKN2AIPQ9NXV6 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDKN2AIPQ9NXV6 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDKN2AIPQ9NXV6 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDKN2AIPQ9NXV6 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDKN2AIPQ9NXV6 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDKN2AIPQ9NXV6 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDKN2AIPQ9NXV6 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDKN2AIPQ9NXV6 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDKN2AIPQ9NXV6 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDKN2AIPQ9NXV6 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDKN2AIPQ9NXV6 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDKN2AIPQ9NXV6 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDKN2AIPQ9NXV6 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDKN2AIPQ9NXV6 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDKN2AIPQ9NXV6 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDKN2AIPQ9NXV6 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDKN2AIPQ9NXV6 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDKN2AIPQ9NXV6 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDKN2AIPQ9NXV6 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDKN2AIPQ9NXV6 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDKN2AIPQ9NXV6 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDKN2AIPQ9NXV6 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDKN2AIPQ9NXV6 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDKN2AIPQ9NXV6 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDKN2AIPQ9NXV6 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDKN2AIPQ9NXV6 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms