Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXL9

MCM9, DNA helicase MCM9, humanhuman

Predictions only

Length 1,143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCM9Q9NXL9 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MCM9Q9NXL9 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MCM9Q9NXL9 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MCM9Q9NXL9 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MCM9Q9NXL9 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MCM9Q9NXL9 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MCM9Q9NXL9 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MCM9Q9NXL9 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
MCM9Q9NXL9 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MCM9Q9NXL9 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MCM9Q9NXL9 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
MCM9Q9NXL9 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MCM9Q9NXL9 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MCM9Q9NXL9 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MCM9Q9NXL9 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MCM9Q9NXL9 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MCM9Q9NXL9 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MCM9Q9NXL9 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MCM9Q9NXL9 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MCM9Q9NXL9 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MCM9Q9NXL9 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
MCM9Q9NXL9 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MCM9Q9NXL9 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
MCM9Q9NXL9 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MCM9Q9NXL9 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
MCM9Q9NXL9 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
MCM9Q9NXL9 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
MCM9Q9NXL9 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MCM9Q9NXL9 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
MCM9Q9NXL9 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MCM9Q9NXL9 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MCM9Q9NXL9 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MCM9Q9NXL9 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MCM9Q9NXL9 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MCM9Q9NXL9 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
MCM9Q9NXL9 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MCM9Q9NXL9 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MCM9Q9NXL9 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MCM9Q9NXL9 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MCM9Q9NXL9 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MCM9Q9NXL9 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
MCM9Q9NXL9 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
MCM9Q9NXL9 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MCM9Q9NXL9 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MCM9Q9NXL9 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MCM9Q9NXL9 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MCM9Q9NXL9 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MCM9Q9NXL9 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MCM9Q9NXL9 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MCM9Q9NXL9 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MCM9Q9NXL9 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MCM9Q9NXL9 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MCM9Q9NXL9 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MCM9Q9NXL9 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MCM9Q9NXL9 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MCM9Q9NXL9 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MCM9Q9NXL9 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MCM9Q9NXL9 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MCM9Q9NXL9 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MCM9Q9NXL9 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MCM9Q9NXL9 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
MCM9Q9NXL9 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MCM9Q9NXL9 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MCM9Q9NXL9 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MCM9Q9NXL9 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MCM9Q9NXL9 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MCM9Q9NXL9 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MCM9Q9NXL9 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MCM9Q9NXL9 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MCM9Q9NXL9 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MCM9Q9NXL9 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MCM9Q9NXL9 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MCM9Q9NXL9 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MCM9Q9NXL9 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MCM9Q9NXL9 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MCM9Q9NXL9 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MCM9Q9NXL9 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MCM9Q9NXL9 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MCM9Q9NXL9 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MCM9Q9NXL9 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MCM9Q9NXL9 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MCM9Q9NXL9 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MCM9Q9NXL9 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MCM9Q9NXL9 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MCM9Q9NXL9 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MCM9Q9NXL9 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MCM9Q9NXL9 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MCM9Q9NXL9 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MCM9Q9NXL9 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
MCM9Q9NXL9 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MCM9Q9NXL9 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MCM9Q9NXL9 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MCM9Q9NXL9 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MCM9Q9NXL9 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MCM9Q9NXL9 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MCM9Q9NXL9 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MCM9Q9NXL9 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MCM9Q9NXL9 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MCM9Q9NXL9 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MCM9Q9NXL9 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms