Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0F1

CEP44, Centrosomal protein of 44 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP44Q9C0F1 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CEP44Q9C0F1 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CEP44Q9C0F1 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
CEP44Q9C0F1 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CEP44Q9C0F1 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
CEP44Q9C0F1 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
CEP44Q9C0F1 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CEP44Q9C0F1 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CEP44Q9C0F1 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CEP44Q9C0F1 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CEP44Q9C0F1 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CEP44Q9C0F1 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CEP44Q9C0F1 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CEP44Q9C0F1 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CEP44Q9C0F1 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CEP44Q9C0F1 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CEP44Q9C0F1 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
CEP44Q9C0F1 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.87
CEP44Q9C0F1 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CEP44Q9C0F1 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CEP44Q9C0F1 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CEP44Q9C0F1 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CEP44Q9C0F1 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CEP44Q9C0F1 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CEP44Q9C0F1 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CEP44Q9C0F1 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CEP44Q9C0F1 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CEP44Q9C0F1 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CEP44Q9C0F1 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CEP44Q9C0F1 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CEP44Q9C0F1 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CEP44Q9C0F1 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CEP44Q9C0F1 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CEP44Q9C0F1 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CEP44Q9C0F1 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CEP44Q9C0F1 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CEP44Q9C0F1 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CEP44Q9C0F1 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CEP44Q9C0F1 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CEP44Q9C0F1 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CEP44Q9C0F1 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CEP44Q9C0F1 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CEP44Q9C0F1 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CEP44Q9C0F1 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CEP44Q9C0F1 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CEP44Q9C0F1 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CEP44Q9C0F1 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CEP44Q9C0F1 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CEP44Q9C0F1 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CEP44Q9C0F1 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CEP44Q9C0F1 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CEP44Q9C0F1 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CEP44Q9C0F1 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CEP44Q9C0F1 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CEP44Q9C0F1 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CEP44Q9C0F1 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CEP44Q9C0F1 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CEP44Q9C0F1 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CEP44Q9C0F1 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CEP44Q9C0F1 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CEP44Q9C0F1 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CEP44Q9C0F1 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CEP44Q9C0F1 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CEP44Q9C0F1 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CEP44Q9C0F1 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CEP44Q9C0F1 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CEP44Q9C0F1 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CEP44Q9C0F1 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CEP44Q9C0F1 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CEP44Q9C0F1 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CEP44Q9C0F1 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CEP44Q9C0F1 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CEP44Q9C0F1 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CEP44Q9C0F1 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CEP44Q9C0F1 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CEP44Q9C0F1 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CEP44Q9C0F1 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CEP44Q9C0F1 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CEP44Q9C0F1 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CEP44Q9C0F1 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CEP44Q9C0F1 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CEP44Q9C0F1 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CEP44Q9C0F1 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CEP44Q9C0F1 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CEP44Q9C0F1 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CEP44Q9C0F1 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CEP44Q9C0F1 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CEP44Q9C0F1 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CEP44Q9C0F1 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CEP44Q9C0F1 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CEP44Q9C0F1 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CEP44Q9C0F1 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CEP44Q9C0F1 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CEP44Q9C0F1 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CEP44Q9C0F1 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CEP44Q9C0F1 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CEP44Q9C0F1 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CEP44Q9C0F1 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CEP44Q9C0F1 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CEP44Q9C0F1 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms