Protein–RNA interactions for Protein: Q96QS3

ARX, Homeobox protein ARX, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARXQ96QS3 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ARXQ96QS3 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ARXQ96QS3 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ARXQ96QS3 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ARXQ96QS3 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ARXQ96QS3 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ARXQ96QS3 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ARXQ96QS3 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ARXQ96QS3 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ARXQ96QS3 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ARXQ96QS3 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ARXQ96QS3 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ARXQ96QS3 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
ARXQ96QS3 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
ARXQ96QS3 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ARXQ96QS3 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ARXQ96QS3 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ARXQ96QS3 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ARXQ96QS3 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ARXQ96QS3 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ARXQ96QS3 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ARXQ96QS3 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
ARXQ96QS3 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
ARXQ96QS3 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ARXQ96QS3 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
ARXQ96QS3 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ARXQ96QS3 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
ARXQ96QS3 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ARXQ96QS3 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ARXQ96QS3 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ARXQ96QS3 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ARXQ96QS3 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ARXQ96QS3 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ARXQ96QS3 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ARXQ96QS3 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ARXQ96QS3 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ARXQ96QS3 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ARXQ96QS3 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ARXQ96QS3 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ARXQ96QS3 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ARXQ96QS3 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ARXQ96QS3 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ARXQ96QS3 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ARXQ96QS3 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ARXQ96QS3 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ARXQ96QS3 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ARXQ96QS3 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ARXQ96QS3 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ARXQ96QS3 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ARXQ96QS3 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ARXQ96QS3 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ARXQ96QS3 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ARXQ96QS3 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ARXQ96QS3 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ARXQ96QS3 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ARXQ96QS3 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ARXQ96QS3 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ARXQ96QS3 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ARXQ96QS3 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ARXQ96QS3 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ARXQ96QS3 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ARXQ96QS3 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ARXQ96QS3 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ARXQ96QS3 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
ARXQ96QS3 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ARXQ96QS3 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ARXQ96QS3 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ARXQ96QS3 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
ARXQ96QS3 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ARXQ96QS3 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ARXQ96QS3 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ARXQ96QS3 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ARXQ96QS3 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ARXQ96QS3 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ARXQ96QS3 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ARXQ96QS3 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ARXQ96QS3 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ARXQ96QS3 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ARXQ96QS3 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ARXQ96QS3 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ARXQ96QS3 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ARXQ96QS3 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ARXQ96QS3 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
ARXQ96QS3 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ARXQ96QS3 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ARXQ96QS3 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ARXQ96QS3 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ARXQ96QS3 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ARXQ96QS3 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ARXQ96QS3 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ARXQ96QS3 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ARXQ96QS3 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ARXQ96QS3 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ARXQ96QS3 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ARXQ96QS3 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ARXQ96QS3 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ARXQ96QS3 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
ARXQ96QS3 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ARXQ96QS3 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ARXQ96QS3 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms