Protein–RNA interactions for Protein: Q96EL3

MRPL53, 39S ribosomal protein L53, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 112 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL53Q96EL3 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MRPL53Q96EL3 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MRPL53Q96EL3 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MRPL53Q96EL3 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MRPL53Q96EL3 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MRPL53Q96EL3 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MRPL53Q96EL3 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MRPL53Q96EL3 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MRPL53Q96EL3 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MRPL53Q96EL3 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MRPL53Q96EL3 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MRPL53Q96EL3 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MRPL53Q96EL3 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MRPL53Q96EL3 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MRPL53Q96EL3 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MRPL53Q96EL3 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MRPL53Q96EL3 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MRPL53Q96EL3 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MRPL53Q96EL3 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MRPL53Q96EL3 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MRPL53Q96EL3 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MRPL53Q96EL3 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
MRPL53Q96EL3 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MRPL53Q96EL3 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MRPL53Q96EL3 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MRPL53Q96EL3 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
MRPL53Q96EL3 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MRPL53Q96EL3 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
MRPL53Q96EL3 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MRPL53Q96EL3 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MRPL53Q96EL3 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MRPL53Q96EL3 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MRPL53Q96EL3 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MRPL53Q96EL3 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MRPL53Q96EL3 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MRPL53Q96EL3 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MRPL53Q96EL3 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MRPL53Q96EL3 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MRPL53Q96EL3 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MRPL53Q96EL3 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MRPL53Q96EL3 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MRPL53Q96EL3 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MRPL53Q96EL3 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MRPL53Q96EL3 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MRPL53Q96EL3 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MRPL53Q96EL3 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MRPL53Q96EL3 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MRPL53Q96EL3 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MRPL53Q96EL3 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MRPL53Q96EL3 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MRPL53Q96EL3 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MRPL53Q96EL3 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MRPL53Q96EL3 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MRPL53Q96EL3 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MRPL53Q96EL3 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MRPL53Q96EL3 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MRPL53Q96EL3 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MRPL53Q96EL3 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MRPL53Q96EL3 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MRPL53Q96EL3 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MRPL53Q96EL3 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MRPL53Q96EL3 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MRPL53Q96EL3 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MRPL53Q96EL3 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MRPL53Q96EL3 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MRPL53Q96EL3 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MRPL53Q96EL3 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MRPL53Q96EL3 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MRPL53Q96EL3 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MRPL53Q96EL3 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MRPL53Q96EL3 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MRPL53Q96EL3 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MRPL53Q96EL3 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MRPL53Q96EL3 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MRPL53Q96EL3 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MRPL53Q96EL3 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
MRPL53Q96EL3 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MRPL53Q96EL3 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MRPL53Q96EL3 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MRPL53Q96EL3 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MRPL53Q96EL3 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MRPL53Q96EL3 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MRPL53Q96EL3 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MRPL53Q96EL3 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MRPL53Q96EL3 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MRPL53Q96EL3 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MRPL53Q96EL3 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MRPL53Q96EL3 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MRPL53Q96EL3 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
MRPL53Q96EL3 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MRPL53Q96EL3 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MRPL53Q96EL3 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MRPL53Q96EL3 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MRPL53Q96EL3 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MRPL53Q96EL3 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MRPL53Q96EL3 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MRPL53Q96EL3 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MRPL53Q96EL3 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MRPL53Q96EL3 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
MRPL53Q96EL3 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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