Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXF1

PSPC1, Paraspeckle component 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 523 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSPC1Q8WXF1 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSPC1Q8WXF1 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSPC1Q8WXF1 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSPC1Q8WXF1 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSPC1Q8WXF1 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSPC1Q8WXF1 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSPC1Q8WXF1 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSPC1Q8WXF1 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSPC1Q8WXF1 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSPC1Q8WXF1 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSPC1Q8WXF1 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSPC1Q8WXF1 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PSPC1Q8WXF1 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PSPC1Q8WXF1 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PSPC1Q8WXF1 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PSPC1Q8WXF1 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PSPC1Q8WXF1 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PSPC1Q8WXF1 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PSPC1Q8WXF1 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PSPC1Q8WXF1 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PSPC1Q8WXF1 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PSPC1Q8WXF1 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PSPC1Q8WXF1 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PSPC1Q8WXF1 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PSPC1Q8WXF1 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PSPC1Q8WXF1 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PSPC1Q8WXF1 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PSPC1Q8WXF1 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PSPC1Q8WXF1 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PSPC1Q8WXF1 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PSPC1Q8WXF1 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PSPC1Q8WXF1 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PSPC1Q8WXF1 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PSPC1Q8WXF1 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PSPC1Q8WXF1 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PSPC1Q8WXF1 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PSPC1Q8WXF1 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PSPC1Q8WXF1 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PSPC1Q8WXF1 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PSPC1Q8WXF1 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PSPC1Q8WXF1 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PSPC1Q8WXF1 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PSPC1Q8WXF1 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PSPC1Q8WXF1 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PSPC1Q8WXF1 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PSPC1Q8WXF1 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PSPC1Q8WXF1 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PSPC1Q8WXF1 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PSPC1Q8WXF1 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PSPC1Q8WXF1 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PSPC1Q8WXF1 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PSPC1Q8WXF1 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PSPC1Q8WXF1 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PSPC1Q8WXF1 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PSPC1Q8WXF1 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PSPC1Q8WXF1 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PSPC1Q8WXF1 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PSPC1Q8WXF1 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PSPC1Q8WXF1 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PSPC1Q8WXF1 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PSPC1Q8WXF1 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PSPC1Q8WXF1 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PSPC1Q8WXF1 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PSPC1Q8WXF1 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PSPC1Q8WXF1 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PSPC1Q8WXF1 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PSPC1Q8WXF1 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PSPC1Q8WXF1 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PSPC1Q8WXF1 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PSPC1Q8WXF1 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PSPC1Q8WXF1 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PSPC1Q8WXF1 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PSPC1Q8WXF1 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PSPC1Q8WXF1 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PSPC1Q8WXF1 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PSPC1Q8WXF1 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PSPC1Q8WXF1 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PSPC1Q8WXF1 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PSPC1Q8WXF1 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PSPC1Q8WXF1 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PSPC1Q8WXF1 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PSPC1Q8WXF1 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PSPC1Q8WXF1 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PSPC1Q8WXF1 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PSPC1Q8WXF1 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PSPC1Q8WXF1 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PSPC1Q8WXF1 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PSPC1Q8WXF1 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PSPC1Q8WXF1 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PSPC1Q8WXF1 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PSPC1Q8WXF1 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PSPC1Q8WXF1 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PSPC1Q8WXF1 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PSPC1Q8WXF1 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PSPC1Q8WXF1 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PSPC1Q8WXF1 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PSPC1Q8WXF1 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PSPC1Q8WXF1 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PSPC1Q8WXF1 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PSPC1Q8WXF1 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
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