Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV48

CCDC107, Coiled-coil domain-containing protein 107, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC107Q8WV48 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC107Q8WV48 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC107Q8WV48 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC107Q8WV48 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CCDC107Q8WV48 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC107Q8WV48 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC107Q8WV48 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC107Q8WV48 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC107Q8WV48 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC107Q8WV48 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC107Q8WV48 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC107Q8WV48 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC107Q8WV48 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC107Q8WV48 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC107Q8WV48 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC107Q8WV48 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC107Q8WV48 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC107Q8WV48 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC107Q8WV48 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC107Q8WV48 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC107Q8WV48 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC107Q8WV48 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC107Q8WV48 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC107Q8WV48 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC107Q8WV48 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC107Q8WV48 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC107Q8WV48 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC107Q8WV48 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC107Q8WV48 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC107Q8WV48 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CCDC107Q8WV48 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC107Q8WV48 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC107Q8WV48 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC107Q8WV48 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC107Q8WV48 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC107Q8WV48 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC107Q8WV48 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC107Q8WV48 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC107Q8WV48 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC107Q8WV48 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC107Q8WV48 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC107Q8WV48 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC107Q8WV48 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC107Q8WV48 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC107Q8WV48 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC107Q8WV48 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC107Q8WV48 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CCDC107Q8WV48 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC107Q8WV48 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC107Q8WV48 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC107Q8WV48 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC107Q8WV48 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC107Q8WV48 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC107Q8WV48 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC107Q8WV48 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC107Q8WV48 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC107Q8WV48 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC107Q8WV48 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC107Q8WV48 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC107Q8WV48 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC107Q8WV48 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC107Q8WV48 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC107Q8WV48 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC107Q8WV48 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC107Q8WV48 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC107Q8WV48 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC107Q8WV48 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC107Q8WV48 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC107Q8WV48 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC107Q8WV48 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CCDC107Q8WV48 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC107Q8WV48 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC107Q8WV48 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC107Q8WV48 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC107Q8WV48 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC107Q8WV48 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC107Q8WV48 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC107Q8WV48 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC107Q8WV48 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC107Q8WV48 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC107Q8WV48 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC107Q8WV48 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC107Q8WV48 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC107Q8WV48 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC107Q8WV48 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC107Q8WV48 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC107Q8WV48 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC107Q8WV48 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC107Q8WV48 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC107Q8WV48 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC107Q8WV48 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CCDC107Q8WV48 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.38
CCDC107Q8WV48 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
CCDC107Q8WV48 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
CCDC107Q8WV48 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
CCDC107Q8WV48 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC107Q8WV48 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC107Q8WV48 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC107Q8WV48 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCDC107Q8WV48 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms