Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDD1

DDX54, ATP-dependent RNA helicase DDX54, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 881 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX54Q8TDD1 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
DDX54Q8TDD1 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.84
DDX54Q8TDD1 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
DDX54Q8TDD1 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
DDX54Q8TDD1 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
DDX54Q8TDD1 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
DDX54Q8TDD1 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
DDX54Q8TDD1 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
DDX54Q8TDD1 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
DDX54Q8TDD1 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
DDX54Q8TDD1 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
DDX54Q8TDD1 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
DDX54Q8TDD1 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
DDX54Q8TDD1 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
DDX54Q8TDD1 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC26.57■■□□□ 1.84
DDX54Q8TDD1 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
DDX54Q8TDD1 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
DDX54Q8TDD1 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
DDX54Q8TDD1 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
DDX54Q8TDD1 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
DDX54Q8TDD1 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
DDX54Q8TDD1 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
DDX54Q8TDD1 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
DDX54Q8TDD1 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
DDX54Q8TDD1 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
DDX54Q8TDD1 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
DDX54Q8TDD1 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
DDX54Q8TDD1 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
DDX54Q8TDD1 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
DDX54Q8TDD1 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
DDX54Q8TDD1 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
DDX54Q8TDD1 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
DDX54Q8TDD1 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
DDX54Q8TDD1 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
DDX54Q8TDD1 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
DDX54Q8TDD1 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
DDX54Q8TDD1 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
DDX54Q8TDD1 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
DDX54Q8TDD1 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
DDX54Q8TDD1 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
DDX54Q8TDD1 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
DDX54Q8TDD1 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
DDX54Q8TDD1 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
DDX54Q8TDD1 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
DDX54Q8TDD1 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
DDX54Q8TDD1 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
DDX54Q8TDD1 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
DDX54Q8TDD1 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
DDX54Q8TDD1 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
DDX54Q8TDD1 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
DDX54Q8TDD1 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
DDX54Q8TDD1 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
DDX54Q8TDD1 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
DDX54Q8TDD1 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
DDX54Q8TDD1 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
DDX54Q8TDD1 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
DDX54Q8TDD1 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
DDX54Q8TDD1 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
DDX54Q8TDD1 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
DDX54Q8TDD1 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
DDX54Q8TDD1 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
DDX54Q8TDD1 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
DDX54Q8TDD1 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
DDX54Q8TDD1 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
DDX54Q8TDD1 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
DDX54Q8TDD1 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
DDX54Q8TDD1 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
DDX54Q8TDD1 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
DDX54Q8TDD1 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
DDX54Q8TDD1 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
DDX54Q8TDD1 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
DDX54Q8TDD1 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
DDX54Q8TDD1 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
DDX54Q8TDD1 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
DDX54Q8TDD1 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.53■■□□□ 1.84
DDX54Q8TDD1 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
DDX54Q8TDD1 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
DDX54Q8TDD1 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
DDX54Q8TDD1 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
DDX54Q8TDD1 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
DDX54Q8TDD1 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
DDX54Q8TDD1 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
DDX54Q8TDD1 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
DDX54Q8TDD1 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
DDX54Q8TDD1 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
DDX54Q8TDD1 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
DDX54Q8TDD1 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
DDX54Q8TDD1 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
DDX54Q8TDD1 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
DDX54Q8TDD1 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC26.52■■□□□ 1.84
DDX54Q8TDD1 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
DDX54Q8TDD1 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
DDX54Q8TDD1 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
DDX54Q8TDD1 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
DDX54Q8TDD1 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
DDX54Q8TDD1 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
DDX54Q8TDD1 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
DDX54Q8TDD1 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
DDX54Q8TDD1 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
DDX54Q8TDD1 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.9 ms