Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4Q1

CHCHD4, Mitochondrial intermembrane space import and assembly protein 40, humanhuman

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Length 142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD4Q8N4Q1 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHCHD4Q8N4Q1 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHCHD4Q8N4Q1 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHCHD4Q8N4Q1 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHCHD4Q8N4Q1 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CHCHD4Q8N4Q1 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHCHD4Q8N4Q1 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CHCHD4Q8N4Q1 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHCHD4Q8N4Q1 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHCHD4Q8N4Q1 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CHCHD4Q8N4Q1 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHCHD4Q8N4Q1 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHCHD4Q8N4Q1 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHCHD4Q8N4Q1 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHCHD4Q8N4Q1 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHCHD4Q8N4Q1 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHCHD4Q8N4Q1 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHCHD4Q8N4Q1 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHCHD4Q8N4Q1 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHCHD4Q8N4Q1 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHCHD4Q8N4Q1 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHCHD4Q8N4Q1 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHCHD4Q8N4Q1 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHCHD4Q8N4Q1 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHCHD4Q8N4Q1 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHCHD4Q8N4Q1 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHCHD4Q8N4Q1 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHCHD4Q8N4Q1 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHCHD4Q8N4Q1 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHCHD4Q8N4Q1 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHCHD4Q8N4Q1 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHCHD4Q8N4Q1 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHCHD4Q8N4Q1 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHCHD4Q8N4Q1 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHCHD4Q8N4Q1 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHCHD4Q8N4Q1 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHCHD4Q8N4Q1 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHCHD4Q8N4Q1 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHCHD4Q8N4Q1 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHCHD4Q8N4Q1 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHCHD4Q8N4Q1 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHCHD4Q8N4Q1 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHCHD4Q8N4Q1 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHCHD4Q8N4Q1 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHCHD4Q8N4Q1 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHCHD4Q8N4Q1 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHCHD4Q8N4Q1 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHCHD4Q8N4Q1 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHCHD4Q8N4Q1 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHCHD4Q8N4Q1 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHCHD4Q8N4Q1 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CHCHD4Q8N4Q1 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHCHD4Q8N4Q1 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHCHD4Q8N4Q1 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHCHD4Q8N4Q1 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHCHD4Q8N4Q1 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHCHD4Q8N4Q1 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHCHD4Q8N4Q1 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHCHD4Q8N4Q1 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CHCHD4Q8N4Q1 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHCHD4Q8N4Q1 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHCHD4Q8N4Q1 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHCHD4Q8N4Q1 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHCHD4Q8N4Q1 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHCHD4Q8N4Q1 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHCHD4Q8N4Q1 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CHCHD4Q8N4Q1 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHCHD4Q8N4Q1 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHCHD4Q8N4Q1 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHCHD4Q8N4Q1 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHCHD4Q8N4Q1 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHCHD4Q8N4Q1 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CHCHD4Q8N4Q1 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHCHD4Q8N4Q1 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHCHD4Q8N4Q1 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHCHD4Q8N4Q1 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHCHD4Q8N4Q1 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHCHD4Q8N4Q1 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHCHD4Q8N4Q1 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CHCHD4Q8N4Q1 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CHCHD4Q8N4Q1 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
CHCHD4Q8N4Q1 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHCHD4Q8N4Q1 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHCHD4Q8N4Q1 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHCHD4Q8N4Q1 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHCHD4Q8N4Q1 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHCHD4Q8N4Q1 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CHCHD4Q8N4Q1 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHCHD4Q8N4Q1 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHCHD4Q8N4Q1 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHCHD4Q8N4Q1 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHCHD4Q8N4Q1 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHCHD4Q8N4Q1 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHCHD4Q8N4Q1 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHCHD4Q8N4Q1 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHCHD4Q8N4Q1 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHCHD4Q8N4Q1 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CHCHD4Q8N4Q1 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHCHD4Q8N4Q1 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHCHD4Q8N4Q1 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
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