Protein–RNA interactions for Protein: Q2M329

CCDC96, Coiled-coil domain-containing protein 96, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC96Q2M329 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC96Q2M329 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC96Q2M329 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC96Q2M329 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC96Q2M329 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC96Q2M329 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC96Q2M329 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC96Q2M329 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC96Q2M329 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC96Q2M329 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC96Q2M329 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC96Q2M329 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC96Q2M329 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC96Q2M329 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC96Q2M329 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC96Q2M329 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC96Q2M329 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC96Q2M329 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC96Q2M329 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC96Q2M329 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC96Q2M329 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC96Q2M329 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC96Q2M329 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC96Q2M329 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC96Q2M329 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC96Q2M329 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC96Q2M329 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC96Q2M329 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC96Q2M329 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC96Q2M329 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC96Q2M329 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC96Q2M329 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC96Q2M329 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC96Q2M329 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC96Q2M329 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC96Q2M329 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC96Q2M329 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC96Q2M329 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC96Q2M329 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC96Q2M329 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC96Q2M329 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC96Q2M329 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC96Q2M329 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC96Q2M329 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC96Q2M329 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC96Q2M329 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC96Q2M329 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC96Q2M329 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC96Q2M329 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC96Q2M329 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC96Q2M329 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC96Q2M329 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC96Q2M329 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC96Q2M329 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC96Q2M329 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC96Q2M329 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC96Q2M329 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC96Q2M329 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC96Q2M329 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC96Q2M329 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC96Q2M329 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC96Q2M329 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC96Q2M329 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC96Q2M329 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC96Q2M329 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC96Q2M329 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC96Q2M329 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC96Q2M329 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC96Q2M329 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC96Q2M329 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC96Q2M329 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC96Q2M329 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC96Q2M329 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC96Q2M329 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC96Q2M329 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC96Q2M329 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC96Q2M329 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC96Q2M329 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC96Q2M329 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC96Q2M329 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC96Q2M329 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC96Q2M329 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC96Q2M329 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC96Q2M329 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC96Q2M329 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC96Q2M329 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC96Q2M329 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC96Q2M329 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC96Q2M329 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC96Q2M329 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC96Q2M329 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC96Q2M329 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC96Q2M329 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC96Q2M329 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC96Q2M329 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC96Q2M329 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC96Q2M329 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC96Q2M329 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC96Q2M329 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC96Q2M329 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms