Protein–RNA interactions for Protein: Q16676

FOXD1, Forkhead box protein D1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD1Q16676 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
FOXD1Q16676 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
FOXD1Q16676 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
FOXD1Q16676 AC130324.1-201ENST00000584157 831 ntTSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
FOXD1Q16676 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
FOXD1Q16676 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
FOXD1Q16676 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
FOXD1Q16676 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
FOXD1Q16676 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
FOXD1Q16676 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC29.8■■■□□ 2.36
FOXD1Q16676 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
FOXD1Q16676 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
FOXD1Q16676 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
FOXD1Q16676 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
FOXD1Q16676 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
FOXD1Q16676 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
FOXD1Q16676 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
FOXD1Q16676 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
FOXD1Q16676 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
FOXD1Q16676 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
FOXD1Q16676 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
FOXD1Q16676 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
FOXD1Q16676 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
FOXD1Q16676 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
FOXD1Q16676 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
FOXD1Q16676 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
FOXD1Q16676 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
FOXD1Q16676 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
FOXD1Q16676 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
FOXD1Q16676 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC29.78■■■□□ 2.36
FOXD1Q16676 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
FOXD1Q16676 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
FOXD1Q16676 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
FOXD1Q16676 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
FOXD1Q16676 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
FOXD1Q16676 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
FOXD1Q16676 BX547991.1-201ENST00000582543 1206 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
FOXD1Q16676 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
FOXD1Q16676 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
FOXD1Q16676 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
FOXD1Q16676 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
FOXD1Q16676 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
FOXD1Q16676 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
FOXD1Q16676 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
FOXD1Q16676 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
FOXD1Q16676 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
FOXD1Q16676 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
FOXD1Q16676 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
FOXD1Q16676 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
FOXD1Q16676 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
FOXD1Q16676 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
FOXD1Q16676 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
FOXD1Q16676 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.36
FOXD1Q16676 AL022393.1-201ENST00000625142 1677 ntBASIC29.76■■■□□ 2.36
FOXD1Q16676 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
FOXD1Q16676 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
FOXD1Q16676 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
FOXD1Q16676 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.35
FOXD1Q16676 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
FOXD1Q16676 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
FOXD1Q16676 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.35
FOXD1Q16676 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.35
FOXD1Q16676 AL137246.1-201ENST00000607072 977 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
FOXD1Q16676 AC107308.1-201ENST00000615897 301 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
FOXD1Q16676 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
FOXD1Q16676 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
FOXD1Q16676 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
FOXD1Q16676 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
FOXD1Q16676 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
FOXD1Q16676 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
FOXD1Q16676 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC29.75■■■□□ 2.35
FOXD1Q16676 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
FOXD1Q16676 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC29.75■■■□□ 2.35
FOXD1Q16676 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
FOXD1Q16676 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
FOXD1Q16676 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
FOXD1Q16676 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
FOXD1Q16676 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
FOXD1Q16676 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC29.75■■■□□ 2.35
FOXD1Q16676 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
FOXD1Q16676 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
FOXD1Q16676 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
FOXD1Q16676 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
FOXD1Q16676 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
FOXD1Q16676 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
FOXD1Q16676 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
FOXD1Q16676 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
FOXD1Q16676 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
FOXD1Q16676 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
FOXD1Q16676 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
FOXD1Q16676 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
FOXD1Q16676 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
FOXD1Q16676 RPL12P24-201ENST00000474907 486 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
FOXD1Q16676 MGAT4D-201ENST00000503109 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
FOXD1Q16676 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
FOXD1Q16676 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
FOXD1Q16676 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
FOXD1Q16676 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
FOXD1Q16676 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
FOXD1Q16676 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms