Protein–RNA interactions for Protein: Q15811

ITSN1, Intersectin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,721 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITSN1Q15811 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ITSN1Q15811 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
ITSN1Q15811 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ITSN1Q15811 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ITSN1Q15811 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ITSN1Q15811 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ITSN1Q15811 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ITSN1Q15811 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ITSN1Q15811 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ITSN1Q15811 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
ITSN1Q15811 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
ITSN1Q15811 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ITSN1Q15811 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ITSN1Q15811 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ITSN1Q15811 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ITSN1Q15811 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ITSN1Q15811 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ITSN1Q15811 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ITSN1Q15811 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ITSN1Q15811 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ITSN1Q15811 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ITSN1Q15811 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ITSN1Q15811 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ITSN1Q15811 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ITSN1Q15811 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
ITSN1Q15811 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ITSN1Q15811 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ITSN1Q15811 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ITSN1Q15811 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ITSN1Q15811 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ITSN1Q15811 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ITSN1Q15811 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ITSN1Q15811 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ITSN1Q15811 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ITSN1Q15811 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ITSN1Q15811 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ITSN1Q15811 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
ITSN1Q15811 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ITSN1Q15811 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ITSN1Q15811 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.04
ITSN1Q15811 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ITSN1Q15811 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ITSN1Q15811 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ITSN1Q15811 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ITSN1Q15811 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ITSN1Q15811 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ITSN1Q15811 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ITSN1Q15811 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ITSN1Q15811 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
ITSN1Q15811 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ITSN1Q15811 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ITSN1Q15811 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
ITSN1Q15811 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ITSN1Q15811 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ITSN1Q15811 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ITSN1Q15811 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ITSN1Q15811 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ITSN1Q15811 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ITSN1Q15811 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ITSN1Q15811 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
ITSN1Q15811 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ITSN1Q15811 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ITSN1Q15811 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ITSN1Q15811 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ITSN1Q15811 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ITSN1Q15811 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
ITSN1Q15811 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ITSN1Q15811 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ITSN1Q15811 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ITSN1Q15811 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ITSN1Q15811 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
ITSN1Q15811 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ITSN1Q15811 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ITSN1Q15811 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ITSN1Q15811 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ITSN1Q15811 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ITSN1Q15811 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ITSN1Q15811 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
ITSN1Q15811 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ITSN1Q15811 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ITSN1Q15811 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ITSN1Q15811 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ITSN1Q15811 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ITSN1Q15811 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
ITSN1Q15811 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
ITSN1Q15811 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ITSN1Q15811 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ITSN1Q15811 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ITSN1Q15811 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ITSN1Q15811 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ITSN1Q15811 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ITSN1Q15811 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ITSN1Q15811 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ITSN1Q15811 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ITSN1Q15811 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ITSN1Q15811 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ITSN1Q15811 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ITSN1Q15811 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ITSN1Q15811 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ITSN1Q15811 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
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