Protein–RNA interactions for Protein: Q15286

RAB35, Ras-related protein Rab-35, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB35Q15286 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB35Q15286 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB35Q15286 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB35Q15286 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB35Q15286 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB35Q15286 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB35Q15286 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB35Q15286 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB35Q15286 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB35Q15286 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB35Q15286 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB35Q15286 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB35Q15286 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB35Q15286 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB35Q15286 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB35Q15286 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB35Q15286 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB35Q15286 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB35Q15286 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB35Q15286 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB35Q15286 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB35Q15286 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB35Q15286 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB35Q15286 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB35Q15286 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB35Q15286 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB35Q15286 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB35Q15286 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB35Q15286 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB35Q15286 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB35Q15286 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB35Q15286 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB35Q15286 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB35Q15286 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB35Q15286 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB35Q15286 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB35Q15286 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB35Q15286 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB35Q15286 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB35Q15286 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB35Q15286 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB35Q15286 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB35Q15286 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB35Q15286 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB35Q15286 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB35Q15286 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB35Q15286 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB35Q15286 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB35Q15286 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB35Q15286 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB35Q15286 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB35Q15286 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB35Q15286 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB35Q15286 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB35Q15286 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB35Q15286 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB35Q15286 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB35Q15286 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB35Q15286 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB35Q15286 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB35Q15286 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB35Q15286 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB35Q15286 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB35Q15286 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB35Q15286 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB35Q15286 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB35Q15286 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB35Q15286 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB35Q15286 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB35Q15286 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB35Q15286 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB35Q15286 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB35Q15286 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB35Q15286 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB35Q15286 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB35Q15286 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB35Q15286 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB35Q15286 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB35Q15286 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB35Q15286 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB35Q15286 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB35Q15286 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB35Q15286 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB35Q15286 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB35Q15286 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB35Q15286 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB35Q15286 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB35Q15286 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB35Q15286 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB35Q15286 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB35Q15286 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB35Q15286 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB35Q15286 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB35Q15286 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB35Q15286 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB35Q15286 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB35Q15286 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB35Q15286 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB35Q15286 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RAB35Q15286 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms